RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524356.1

PCM1-223, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 2

Gene PCM1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-223	ENST00000524356	OR2F1	Q13607	317 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	TRIQK	Q629K1	86 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	TMEM42	Q69YG0	159 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	SPINK14	Q6IE38	97 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	OR6V1	Q8N148	313 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	NATD1	Q8N6N6	113 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	GATD1	Q8NB37	220 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	PATE1	Q8WXA2	126 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	DOK1	Q99704	481 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	VAX2	Q9UIW0	290 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	MOK	Q9UQ07	419 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	ABCA4	P78363	2273 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	COL6A5	A8TX70	2615 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356		A0A0D9SEW6	157 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	LINC01619	G3V211	115 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	KLRC4	O43908	158 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	RDH16	O75452	317 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	SERPINB7	O75635	380 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	OR2B3	O76000	313 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	VENTX	O95231	258 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	CNIH1	O95406	144 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	MYL9	P24844	172 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	PAX6	P26367	422 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	HTR1E	P28566	365 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	TSPO	P30536	169 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	CHRNB4	P30926	498 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	GNB1	P62873	340 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	REG3A	Q06141	175 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	FMOD	Q06828	376 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	TNFRSF9	Q07011	255 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	BAX	Q07812	192 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	INCA1	Q0VD86	236 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	POU6F1	Q14863	301 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	QPRT	Q15274	297 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	OR1Q1	Q15612	314 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	HIST3H3	Q16695	136 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	CDNF	Q49AH0	187 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	LEMD1	Q68G75	181 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	LCN12	Q6JVE5	192 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	XKRX	Q6PP77	449 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	LRRC29	Q8WV35	223 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	ASB13	Q8WXK3	278 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	SMIM12	Q96EX1	92 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	OR10C1	Q96KK4	312 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF597	Q96LX8	424 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	RDH12	Q96NR8	316 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	ZIM3	Q96PE6	472 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	PHB2	Q99623	299 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	DDA1	Q9BW61	102 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	DMAC2	Q9NW81	257 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	GLTP	Q9NZD2	209 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	STAB1	Q9NY15	2570 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356		A0A1B0GV72	72 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	CLDN24	A6NM45	220 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	FAM72C	H0Y354	149 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	TCAP	O15273	167 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	CST2	P09228	141 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	GKN3P	P0CG01	181 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PCM1-223	ENST00000524356	CD99	P14209	185 aa		3.19	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms