RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LYG2Q86SG7 212 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATOH7Q8N100 152 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BHLHE23Q8NDY6 225 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PXT1Q8NFP0 134 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR2M4Q96R27 311 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZBTB18Q99592 522 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAAP24Q9BTP7 215 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C12orf4Q9NQ89 552 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DDIT4Q9NX09 232 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 POMPQ9Y244 141 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KLF12Q9Y4X4 402 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NRCAMQ92823 1304 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHD6Q8TD26 2715 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AKAP6Q13023 2319 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SIPA1L1O43166 1804 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBDO15205 165 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KLRC4O43908 158 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRGC1P0CF51 173 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBBP0CG47 229 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCR2P41597 374 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM3AP98173 230 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PSG9Q00887 426 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C5orf64Q2M2E5 130 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CEACAM16Q2WEN9 425 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACTBL2Q562R1 376 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CFAP157Q5JU67 520 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DRAM2Q6UX65 266 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM156Q8N614 296 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 YIPF7Q8N8F6 280 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR1M1Q8NGA1 313 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR52E5Q8NH55 327 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZFAND1Q8TCF1 268 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMCR5Q8TEV8 140 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC7A6Q92536 515 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRSS27Q9BQR3 290 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ERP44Q9BS26 406 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHID1Q9BWS9 393 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C11orf49Q9H6J7 331 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKRA2Q9H9E1 313 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PROK2Q9HC23 129 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MCUBQ9NWR8 336 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WNK1Q9H4A3 2382 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 JMJD1CQ15652 2540 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IRGMA1A4Y4 181 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GFAPP14136 432 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STMN1P16949 149 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RHOAP61586 193 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF846Q147U1 533 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CEP55Q53EZ4 464 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EBLN2Q6P2I7 272 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RUFY3Q7L099 469 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM86AQ8N2M4 240 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NT5CQ8TCD5 201 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ELMO1Q92556 727 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CENPKQ9BS16 269 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC25A31Q9H0C2 315 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TLNRD1Q9H1K6 362 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD209Q9NNX6 404 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC2A9Q9NRM0 540 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HPF1Q9NWY4 346 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PITPNC1Q9UKF7 332 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KANK1Q14678 1352 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TGP01266 2768 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HACD1B0YJ81 288 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 H7C2G1 150 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MPDU1O75352 247 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HYPMO75409 117 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPBPP02775 128 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SHBGP04278 402 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRT16P08779 473 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATP6V1E1P36543 226 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAB25P57735 213 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MLF1P58340 268 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FGF12P61328 243 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM31Q5JXX7 168 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM27BQ5VT28 67 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC25A24Q6NUK1 477 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM220Q6QAJ8 160 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DOLPP1Q86YN1 238 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NELFCDQ8IXH7 590 aa-1.51□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms