RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516666.1

RNU6-1332P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1332, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1332P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1332P-201ENST00000516666 C1QCP02747 245 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ESDP10768 282 aa0.37□□□□□ -2.35
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RNU6-1332P-201ENST00000516666 CCR7P32248 378 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RPL14P50914 215 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
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RNU6-1332P-201ENST00000516666 TRAM1Q15629 374 aa0.37□□□□□ -2.35
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RNU6-1332P-201ENST00000516666 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa0.35□□□□□ -2.35
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RNU6-1332P-201ENST00000516666 hCG_2039718K7EN88 272 aa0.35□□□□□ -2.35
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RNU6-1332P-201ENST00000516666 ACBD6Q9BR61 282 aa0.34□□□□□ -2.36
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RNU6-1332P-201ENST00000516666 OR51E2Q9H255 320 aa0.34□□□□□ -2.36
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RNU6-1332P-201ENST00000516666 CCL3P10147 92 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GPX2P18283 190 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GADD45AP24522 165 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CDK2P24941 298 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PSMB3P49720 205 aa0.33□□□□□ -2.36
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