RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 H3BUX3 64 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 SYNGR1O43759 233 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 ANGPTL7O43827 346 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 GATBO75879 557 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF728P0DKX0 622 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 DYNLT3P51808 116 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 HERPUD1Q15011 391 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 SLC25A30Q5SVS4 291 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 TRAT1Q6PIZ9 186 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 ASRGL1Q7L266 308 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 CATSPERDQ86XM0 798 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 MKXQ8IYA7 352 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 ENTHD1Q8IYW4 607 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 YIPF7Q8N8F6 280 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 OR11H6Q8NGC7 330 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 OR4C13Q8NGP0 309 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 MALSU1Q96EH3 234 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 CEP19Q96LK0 163 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 IL4I1Q96RQ9 567 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 GABARAPL3Q9BY60 117 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 PPA2Q9H2U2 334 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 PLEKHA1Q9HB21 404 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 RHOFQ9HBH0 211 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 C19orf12Q9NSK7 152 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 PITPNC1Q9UKF7 332 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 WNK2Q9Y3S1 2297 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1W2PRD5 423 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1W2PRF3 423 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1W2PRM7 423 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ODF3BA8MYP8 253 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 SYT7O43581 403 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 PRAF2O60831 178 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF737O75373 536 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 CYB5AP00167 134 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 MT-ND2P03891 347 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 TFF1P04155 84 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ISG15P05161 165 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 PRKACBP22694 351 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 AADACP22760 399 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ERP29P30040 261 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ATP6V1E1P36543 226 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 RBP2P50120 134 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 DLX1P56177 255 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 DLX6P56179 175 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 CDC42P60953 191 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ACTC1P68032 377 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ACTA1P68133 377 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF146Q15072 292 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 UBE2V2Q15819 145 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 SPIN3Q5JUX0 258 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 MINOS1Q5TGZ0 78 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM244Q5VVB8 128 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 UTS2BQ765I0 119 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 GDPD3Q7L5L3 318 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 FAM220AQ7Z4H9 259 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ANGPTL5Q86XS5 388 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 Q8N2B8 174 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 PNKDQ8N490 385 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OR4D10Q8NGI6 311 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OR13D1Q8NGV5 346 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 PIFOQ8TCI5 191 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 RORBQ92753 470 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 BORCS8Q96FH0 119 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 C2orf48Q96LS8 159 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF488Q96MN9 340 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 CIB1Q99828 191 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 CABLES2Q9BTV7 478 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 CHST5Q9GZS9 411 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 NEK6Q9HC98 313 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 GPR173Q9NS66 373 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 GLS2Q9UI32 602 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 LINC00312Q9Y6C7 94 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 hADV38S2A0JD32 116 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 FUOMA2VDF0 154 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 SNTNA6NMZ2 147 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OPN1MWP04001 364 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ALDOBP05062 364 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OPN1MW2P0DN77 364 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OPN1MW3P0DN78 364 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 IGHV1-8P0DP01 117 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 CCL3L1P16619 93 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ATP1B3P54709 279 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM50BP56557 158 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ACTA2P62736 377 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ACTG2P63267 376 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms