RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OR5B21A6NL26 309 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 TRPC5OSA6NMA1 111 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 CENPXA8MT69 81 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 GOSR2O14653 212 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 HSD17B6O14756 317 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SOX15O60248 233 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OR7A10O76100 309 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 NR2C1P13056 603 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 NQO1P15559 274 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 FASP25445 335 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SPRP35270 261 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 VHLP40337 213 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 NPBWR2P48146 333 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 CSNK1A1P48729 337 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SRP9P49458 86 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 RGS6P49758 472 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 GDI2P50395 445 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 P2RY4P51582 365 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 MNAT1P51948 309 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 FOXA1P55317 472 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 COPZ1P61923 177 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 HPCAP84074 193 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 BNIP2Q12982 314 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 KLRD1Q13241 179 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 IL18R1Q13478 541 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OR5I1Q13606 314 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SOHLH1Q5JUK2 328 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 FAM201AQ5SY85 155 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PVRIGQ6DKI7 326 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 ARL9Q6T311 187 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PGAP1Q75T13 922 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 CTAGE3PQ8IX95 158 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 Q8N2B8 174 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 CADM2Q8N3J6 435 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PNKDQ8N490 385 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC75AQ8NAA5 344 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 C19orf18Q8NEA5 215 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OR4D6Q8NGJ1 314 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OR5D16Q8NGK9 328 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OR11L1Q8NGX0 322 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OR52E5Q8NH55 327 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 FNDC8Q8TC99 324 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SEC22AQ96IW7 307 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OR7D2Q96RA2 312 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 DPY30Q9C005 99 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 JPT2Q9H910 190 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 EHFQ9NZC4 300 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 ABCD2Q9UBJ2 740 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 LYSTQ99698 3801 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 H3BSA7 217 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 TSPAN13O95857 204 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 MYCNOSP40205 109 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 LEPP41159 167 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 UBE2E1P51965 193 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PUDPQ08623 228 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 ECH1Q13011 328 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PSG7Q13046 419 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 STX3Q13277 289 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OR8B8Q15620 311 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 MAPK14Q16539 360 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 DGUOKQ16854 277 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 CNPY1Q3B7I2 92 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM255AQ5JRV8 349 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 FAM27D1Q5T7N8 215 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 RNLSQ5VYX0 342 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 FAM219BQ5XKK7 198 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 REG3GQ6UW15 175 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF836Q6ZNA1 936 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OLIG3Q7RTU3 272 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 HMGN2P46Q86SG4 172 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 APRG1Q8IVJ8 170 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 CMTM1Q8IZ96 169 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC18Q8N456 261 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 ZNRF1Q8ND25 227 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 BEST4Q8NFU0 473 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OR4K5Q8NGD3 323 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OR10AD1Q8NGE0 317 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 MFSD8Q8NHS3 518 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 RHOXF1Q8NHV9 184 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 LYPD6BQ8NI32 183 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 ENKURQ8TC29 256 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 TCP10LQ8TDR4 215 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 C10orf82Q8WW14 230 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 CAPSLQ8WWF8 208 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PPP1R14BQ96C90 147 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 LINC00167Q96N53 147 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 MOB1AQ9H8S9 216 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms