RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	GALM	Q96C23	342 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	ETV7	Q9Y603	341 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	SERPINE3	A8MV23	424 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	LY6L	H3BQJ8	138 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	RAB27B	O00194	218 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	MFNG	O00587	321 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	CD3G	P09693	182 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	IL3RA	P26951	378 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	RAB7A	P51149	207 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	HTD2	P86397	168 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	IDNK	Q5T6J7	187 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	LINC00311	Q8N616	119 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	PHF21A	Q96BD5	680 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		13.26	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	RGS11	O94810	467 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	HLA-DRB3	P79483	266 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	STEAP3	Q658P3	488 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	MRAP	Q8TCY5	172 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	R3HDM4	Q96D70	268 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148		A0A075B6Q4	140 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1W2PPE3	182 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	HSD17B6	O14756	317 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	LPL	P06858	475 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	GNB3	P16520	340 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	TGFBR1	P36897	503 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	REC114	Q7Z4M0	266 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	OR8H3	Q8N146	312 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148		Q9N2K0	584 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	13.24	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	TXNL1	O43396	289 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	YPEL1	O60688	119 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	GABARAP	O95166	117 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	GNMT	Q14749	295 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	MORN2	Q502X0	79 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	DTX3	Q8N9I9	347 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	YPEL2	Q96QA6	119 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1W2PPI3	338 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1W2PRX2	142 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	SLC31A2	O15432	143 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	FCGR3A	P08637	254 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	SERPINB10	P48595	397 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF137P	P52743	207 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	NCS1	P62166	190 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	ARFRP1	Q13795	201 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	KIR2DS1	Q14954	304 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	GPR141	Q7Z602	305 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	OR4F4	Q96R69	305 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	SPATA2	Q9UM82	520 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148		A0A0A6YYH2	397 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148		A6NJ64	397 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	IGLL1	P15814	213 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	CD24	P25063	80 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	TALDO1	P37837	337 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	ALDH3B2	P48448	385 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	VBP1	P61758	197 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	CD83	Q01151	205 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	OR56B4	Q8NH76	319 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		13.2	□□□□□ -0.3

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