RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 LINC01548A6NM66 108 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 C8orf88P0DMB2 117 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 FLOT2Q14254 428 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 HES1Q14469 280 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 CT45A3Q8NHU0 189 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 DDB2Q92466 427 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 MARC2Q969Z3 335 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 RDH12Q96NR8 316 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 IL4I1Q96RQ9 567 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 IMPAD1Q9NX62 359 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 TVP23BQ9NYZ1 205 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 MSGN1A6NI15 193 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 SLC22A1O15245 554 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 CD40LGP29965 261 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 ALDH3A2P51648 485 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 ANKRD55Q3KP44 614 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 Q6ZWC4 215 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 SSX6Q7RTT6 188 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 OR13C3Q8NGS6 347 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 FGGYQ96C11 551 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 OR14A2Q96R54 314 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 UQCC2Q9BRT2 126 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 NOTCH1P46531 2555 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 C12orf77C9JDV5 145 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 OGG1O15527 345 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 LGALS7P47929 136 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF251Q9BRH9 671 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF221Q9UK13 617 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 HCCSP53701 268 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 LHFPL3Q86UP9 236 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 OR52N1Q8NH53 320 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 GATAD1Q8WUU5 269 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 TM2D1Q9BX74 207 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 VCXQ9H320 206 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM138Q9NPI0 162 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 WASHC3Q9Y3C0 194 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 FAM25EA8MYX2 175 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 F2RL1P55085 397 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 SPATA24Q86W54 205 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 PPP1R27Q86WC6 154 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 PQLC1Q8N2U9 271 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 NKAIN3Q8N8D7 197 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 POC5Q8NA72 575 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 PHYHIPQ92561 330 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 AIPO00170 330 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 ST8SIA5O15466 376 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 ATP6V1G1O75348 118 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 TFAP2AP05549 437 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 GABRB1P18505 474 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 ACTBP60709 375 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 Q6ZS49 121 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 GPHB5Q86YW7 130 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 ARL11Q969Q4 196 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 CEPT1Q9Y6K0 416 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 WNK1Q9H4A3 2382 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 RAB29O14966 203 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 GTF2F2P13984 249 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 CD24P25063 80 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 MAS1LP35410 378 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 MED21Q13503 144 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 RSU1Q15404 277 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 CYP2R1Q6VVX0 501 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 TCEANCQ8N8B7 351 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 FBLIM1Q8WUP2 373 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 Q96MT0 163 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 GGTLC1Q9BX51 225 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 KLK15Q9H2R5 256 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 IFI27L2Q9H2X8 130 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 ING3Q9NXR8 418 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 SLC2A8Q9NY64 477 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-210ENST00000503258 H0YJW9 148 aa5.84□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 CNIH1O95406 144 aa5.84□□□□□ -1.48
PDE4D-210ENST00000503258 NFYBP25208 207 aa5.84□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms