RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 KBTBD11O94819 623 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 BCL3P20749 454 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 MSX1P28360 303 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 SPATA46Q5T0L3 261 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 DERL1Q9BUN8 251 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 MTCH1Q9NZJ7 389 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 A6NCN8 305 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 CDKN1AP38936 164 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 YPEL5P62699 121 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 FAM89BQ8N5H3 189 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 A0A0G2JRQ6 117 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 A8MXE2 369 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF732B4DXR9 585 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 ZIC3O60481 467 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 NAPSAO96009 420 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 GALNSP34059 522 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 C1orf194Q5T5A4 169 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 TMEM170AQ8WVE7 144 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 C22orf15Q8WYQ4 148 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 RAB40CQ96S21 281 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 CLDN16Q9Y5I7 305 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 MTCH2Q9Y6C9 303 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa10.27□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 B4E171 279 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 TSPAN7P41732 249 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 Q56UQ5 140 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 PHYHD1Q5SRE7 291 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 OR5L2Q8NGL0 311 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 RFESDQ8TAC1 157 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 SPSB1Q96BD6 273 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 EFNA2O43921 213 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 IGKV1D-12P01611 117 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 ATP5G3P48201 142 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 ARL16Q0P5N6 197 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 CEACAM16Q2WEN9 425 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 LEMD1Q68G75 181 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 SSMEM1Q8WWF3 244 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 IL23AQ9NPF7 189 aa10.26□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 SLC22A20A6NK97 555 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 RAB29O14966 203 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 LINC01565O15544 149 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 HOXA6P31267 233 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 ADMP35318 185 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 KIR2DS4P43632 304 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 KIR2DS1Q14954 304 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 GCSAMLQ5JQS6 135 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 Q6ZS52 159 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 NINJ1Q92982 152 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 OR6C1Q96RD1 312 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 CEACAM18A8MTB9 384 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 ZFAND5O76080 213 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 IGKV3-11P04433 115 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 F2RP25116 425 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 LMO1P25800 156 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 G6PCP35575 357 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 GBGT1Q8N5D6 347 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 OR10G8Q8NGN5 311 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 PLEKHA3Q9HB20 300 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 ASCL3Q9NQ33 180 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 TMEM106BQ9NUM4 274 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 B3GAT1Q9P2W7 334 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 C5orf49A4QMS7 147 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 DEFB108AA8MXU0 73 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 IL18BPO95998 194 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 PFN1P07737 140 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 CFPP27918 469 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 DTX1Q86Y01 620 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 LYPD6Q86Y78 171 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 OR1F12Q8NHA8 337 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 CLDN23Q96B33 292 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 MIEN1Q9BRT3 115 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 RPH3ALQ9UNE2 315 aa10.25□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa10.24□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 TP53I11O14683 189 aa10.24□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 FXYD3Q14802 87 aa10.24□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 C7orf61Q8IZ16 206 aa10.24□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 A0A1B0GX78 115 aa10.24□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 CXCL13O43927 109 aa10.24□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 IGHEP01854 428 aa10.24□□□□□ -0.77
PRRX1-207ENST00000497230 RAC2P15153 192 aa10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms