RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495653.1

PTPN23-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 23, human

TSL 2

Gene PTPN23, Length 676 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN23-205	ENST00000495653	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	MFNG	O00587	321 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	YPEL1	O60688	119 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	SCT	P09683	121 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	GNB3	P16520	340 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	TMEM11	P17152	192 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	TGFBR1	P36897	503 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF137P	P52743	207 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	C11orf88	Q6PI97	169 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	DTX3	Q8N9I9	347 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	PTX4	Q96A99	478 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	YIPF6	Q96EC8	236 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	YPEL2	Q96QA6	119 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653		Q9N2K0	584 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPN23-205	ENST00000495653	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	ST8SIA5	O15466	376 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	RGS11	O94810	467 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	LPL	P06858	475 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	CD3G	P09693	182 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	HERPUD1	Q15011	391 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	STEAP3	Q658P3	488 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	TXNL1	O43396	289 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	LANCL1	O43813	399 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	AIRE	O43918	545 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	PEX14	O75381	377 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	FCGR3A	P08637	254 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	OR3A3	P47888	321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	EBI3	Q14213	229 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	IDNK	Q5T6J7	187 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	TRDC	B7Z8K6	153 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653		M0QZK8	103 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	HSPA12A	O43301	675 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	CD1B	P29016	333 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	ARFRP1	Q13795	201 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	TREML4	Q6UXN2	200 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653		Q8N6K4	173 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	SERPINE3	A8MV23	424 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653		M0QZ24	198 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	FBXO24	O75426	580 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	TSPAN15	O95858	294 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	SMIM18	P0DKX4	95 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	CD28	P10747	220 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	ZBTB25	P24278	435 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	CEACAM6	P40199	344 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	LSAMP	Q13449	338 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	CDNF	Q49AH0	187 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	TMEM235	A6NFC5	223 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	FABP7	O15540	132 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	FGF16	O43320	207 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	MOS	P00540	346 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	GSTT2	P0CG29	244 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	GSTT2B	P0CG30	244 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	TALDO1	P37837	337 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PTPN23-205	ENST00000495653	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63

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