RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAPPC2LH3BP13 241 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 K7EMT4 169 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFAB1O14561 156 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 CBR3O75828 277 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 YIF1AO95070 293 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 APCSP02743 223 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SERPINE2P07093 398 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 C8GP07360 202 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC35E2BP0CK96 405 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 IVDP26440 423 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 EVI2BP34910 448 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 FABP6P51161 128 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 P2RX1P51575 399 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP10-10P60014 251 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1CBP62140 327 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PLCXD2Q0VAA5 305 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 STX4Q12846 297 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXF1Q12946 379 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SLAMF1Q13291 335 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 QPRTQ15274 297 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PLPPR5Q32ZL2 321 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 COX19Q49B96 90 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 UBE2UQ5VVX9 321 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC25A34Q6PIV7 304 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 CMC1Q7Z7K0 106 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 HMGN2P46Q86SG4 172 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 ZIC4Q8N9L1 334 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 GATSQ8NAP1 163 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 OR4K5Q8NGD3 323 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 OR9A2Q8NGT5 310 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM230Q96A57 120 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF488Q96MN9 340 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF145Q96MT1 663 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 TSPAN32Q96QS1 320 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 AIF1LQ9BQI0 150 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 POTEKPQ9BYX7 375 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM192AQ9GZU8 254 aa1.79□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 OR6C70A6NIJ9 312 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM64CA6NLI5 447 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 E5RI56 91 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 M0R1B8 84 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 TP53I11O14683 189 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PIN1P1O15428 100 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 RBBP9O75884 186 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 CT45A6P0DMU7 189 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 CT45A5P0DMU8 189 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 CT45A7P0DMV0 189 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB3AP20336 220 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PRTN3P24158 256 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SRP14P37108 136 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SSR2P43308 183 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 MAGEA1P43355 309 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PPICP45877 212 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 XKP51811 444 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR3P79522 188 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SARNPP82979 210 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF117Q03924 483 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 LIPEQ05469 1076 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 HIKESHIQ53FT3 197 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 CT45A1Q5HYN5 189 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 AVPI1Q5T686 147 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 STEAP4Q687X5 459 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 TTC23LQ6PF05 361 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 Q6ZT83 130 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00523Q86TU6 105 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC8AQ8IWT6 810 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SYCE1Q8N0S2 351 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 OTUD6BQ8N6M0 293 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 COX18Q8N8Q8 333 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 CHST4Q8NCG5 386 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 OR6N1Q8NGY5 312 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 OR52P1PQ8NH57 321 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2V1Q8NHB1 315 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 CT45A3Q8NHU0 189 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 LYPD6BQ8NI32 183 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PTX4Q96A99 478 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF5Q99942 180 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PCBD2Q9H0N5 130 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 OR52D1Q9H346 318 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 BEX1Q9HBH7 125 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 NEK6Q9HC98 313 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 MED29Q9NX70 200 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PTTG3PQ9NZH4 202 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 MTFP1Q9UDX5 166 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-211ENST00000489450 DKKL1Q9UK85 242 aa1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.6 ms