RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484918.1

MRPL23-209, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, human

TSL 5

Gene MRPL23, Length 232 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL23-209	ENST00000484918	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	AMELY	Q99218	206 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918		A0A1W2PS18	150 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	LINC00473	A8K010	186 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	SPINT2	O43291	252 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	SULT1B1	O43704	296 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF44	P15621	663 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	PAX5	Q02548	391 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	RNF2	Q99496	336 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	CD300A	Q9UGN4	299 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918		A0A0U1RQV5	110 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	OR2J3	O76001	311 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	DFFB	O76075	338 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	PSMB6	P28072	239 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	CALCOCO2	Q13137	446 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	OR4K13	Q8NH42	304 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	TAMM41	Q96BW9	452 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	ZIM3	Q96PE6	472 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	ABHD6	Q9BV23	337 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	SOX14	O95416	240 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	HTD2	P86397	168 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	SCN1B	Q07699	218 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	RIPK1	Q13546	671 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	PCLAF	Q15004	111 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	RAB40C	Q96S21	281 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	RNF5	Q99942	180 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918		S4R3C0	116 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918		H0YJW9	148 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918		H3BNX3	289 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	HSPB6	O14558	160 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	ARPC3	O15145	178 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	GSC2	O15499	205 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	RBBP9	O75884	186 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	SPDEF	O95238	335 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF682	O95780	498 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	IL6	P05231	212 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	RPA2	P15927	270 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRPL23-209	ENST00000484918	GCA	P28676	217 aa		4.04	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms