RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 WNT16Q9UBV4 365 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 GLOD5A6NK44 160 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR11H12B2RN74 326 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TEX22C9J3V5 150 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 J3QR89 54 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MPPED1O15442 326 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 HCRTR1O43613 425 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 PDE6DO43924 150 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 NKX2-2O95096 273 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MT-CO2P00403 227 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TNFP01375 233 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CFIP05156 583 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 H2BFMP0C1H6 154 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CISD3P0C7P0 127 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 IGLC1P0CG04 106 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 IL3RAP26951 378 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 COL8A1P27658 744 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CD1BP29016 333 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CLRN1P58418 232 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 RAC3P60763 192 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SEC11AP67812 179 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MEP1BQ16820 701 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 FHL5Q5TD97 284 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CALHM1Q8IU99 346 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 Q8N976 141 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR11H1Q8NG94 326 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR11H2Q8NH07 326 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 FAM222BQ8WU58 562 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ASB10Q8WXI3 467 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 C8orf44Q96CB5 159 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TM2D1Q9BX74 207 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 PARLQ9H300 379 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 FAM206AQ9NX38 181 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 GNG13Q9P2W3 67 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TRPM6Q9BX84 2022 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GVT2 93 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PQM1 296 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 DPRXA6NFQ7 191 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 M0QZ24 198 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TAX1BP3O14907 124 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TBL1XO60907 577 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF737O75373 536 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 NTN1O95631 604 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 IGLV1-40P01703 118 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 IGHMP01871 453 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LINC00869P0C866 280 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 KITLGP21583 273 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LHX2P50458 406 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LOXL3P58215 753 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZXDAP98168 799 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MUC3AQ02505 3323 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TLE3Q04726 772 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ARFRP1Q13795 201 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 RTP5Q14D33 572 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR8B8Q15620 311 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 HLA-BQ31612 363 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TDRG1Q3Y452 100 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 GAGE13Q4V321 117 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF793Q6ZN11 406 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 RFLNAQ6ZTI6 216 aa6.12□□□□□ -1.43
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