RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478075.1

CALD1-218, Transcript of caldesmon 1, humanhuman

TSL 3

Gene CALD1, Length 193 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1-218ENST00000478075 MT1MQ8N339 61 aa-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 OR10W1Q8NGF6 305 aa-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 OR4P4Q8NGL7 312 aa-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 OR9G4Q8NGQ1 327 aa-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 PFN4Q8NHR9 129 aa-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 RSPH1Q8WYR4 309 aa-1.04□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 THRSPQ92748 146 aa-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP-1.04□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 TMEM230Q96A57 120 aa-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 MICU1Q9BPX6 476 aa-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 SLC50A1Q9BRV3 221 aa-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 AGMATQ9BSE5 352 aa-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 PITPNC1Q9UKF7 332 aa-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 SNX12Q9UMY4 172 aa-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 WASHC3Q9Y3C0 194 aa-1.04□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 ACACBO00763 2458 aa-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 SIP14410 1827 aa-1.04□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 COL4A6Q14031 1691 aa-1.04□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 PLCE1Q9P212 2302 aa-1.05□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 TTC21AQ8NDW8 1320 aa-1.05□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 ZNF815PA8K554 130 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 OR11H12B2RN74 326 aa-1.05□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 K7EP34 96 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 SIRPB1O00241 398 aa-1.05□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 CCNB2O95067 398 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 CLIC3O95833 236 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 PPYP01298 95 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 MT2AP02795 61 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 TYMSP04818 313 aa-1.05□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa-1.05□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 CCR1P32246 355 aa-1.05□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 MYCNOSP40205 109 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 CRATP43155 626 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 EMP1P54849 157 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 TSPEAR-AS2P59090 65 aa-1.05□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 HAMPP81172 84 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 FAM3AP98173 230 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 BSPH1Q075Z2 132 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 PPP1R1AQ13522 171 aa-1.05□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 TMEM215Q68D42 235 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 DRAM2Q6UX65 266 aa-1.05□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 APRG1Q8IVJ8 170 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 ELMOD2Q8IZ81 293 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 SLC38A6Q8IZM9 456 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa-1.05□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 OR52K1Q8NGK4 314 aa-1.05□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 OR11H2Q8NH07 326 aa-1.05□□□□□ -2.58
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