RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 ITPR2Q14571 2701 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 TRDCB7Z8K6 153 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 DVL1O14640 695 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 MGST3O14880 152 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 IGHV3-7P01780 117 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 OR5H8P0DN80 308 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 PI3P19957 117 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 SHEQ5VZ18 495 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 SLC35E4Q6ICL7 350 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 CLRN3Q8NCR9 226 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 C12orf77C9JDV5 145 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 DHRS2Q13268 280 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 ODAMA1E959 279 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 TEX46H3BTG2 121 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 APOC3P02656 99 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 TCF23Q7RTU1 214 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 FAHD2AQ96GK7 314 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 PRRT1Q99946 306 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 CHODLQ9H9P2 273 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 C19orf12Q9NSK7 152 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 COMMD9Q9P000 198 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 EDARQ9UNE0 448 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 NKX6-3A6NJ46 265 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 GOSR1O95249 250 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 FCGR2CP31995 323 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 AADACL3Q5VUY0 350 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 RAB19A4D1S5 217 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 DISC1C4P0D8 188 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 CD34P28906 385 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 ATP5J2P56134 94 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 TAS2R46P59540 309 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 FXYD4P59646 89 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 HLA-DRB3P79483 266 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 OR52L2PQ8NGH6 319 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 VSIG4Q9Y279 399 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-217ENST00000475693 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 GNMTQ14749 295 aa14.96□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ARL11Q969Q4 196 aa14.96□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.96□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 TAS2R3Q9NYW6 316 aa14.96□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 DSCAML1Q8TD84 2053 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 HBZP02008 142 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 DLX1P56177 255 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 NDUFB3O43676 98 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 MMP23AO75900 390 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 RPS2P15880 293 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ZBTB25P24278 435 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ATRAIDQ6UW56 229 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 LYG2Q86SG7 212 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 OR5D13Q8NGL4 314 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 PPP1R35Q8TAP8 253 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 RAB1CQ92928 201 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 LEAP2Q969E1 77 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 TOMM40LQ969M1 308 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 GPHA2Q96T91 129 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 RNF222A6NCQ9 220 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 CCL3L1P16619 93 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 AADACP22760 399 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM33P57088 247 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 TERB2Q8NHR7 220 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 MITD1Q8WV92 249 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-217ENST00000475693 NUDT19A8MXV4 375 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms