RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 TNCP24821 2201 aa8.65□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PN81 502 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 NBR2O15453 112 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 ST8SIA5O15466 376 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 TXNL1O43396 289 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 HLA-DRB1P01911 266 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 MAS1P04201 325 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 GP9P14770 177 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 MGMTP16455 207 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 CHRNA7P36544 502 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 RASSF2P50749 326 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 RUNX1Q01196 453 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 DEFA5Q01523 94 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 C6orf183Q5T699 404 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 OR10K2Q6IF99 312 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 ZNF429Q86V71 674 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 MINDY2Q8NBR6 621 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 ABHD5Q8WTS1 349 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 SMIM19Q96E16 107 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 Q96MT0 163 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 TOLLIPQ9H0E2 274 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 PALMDQ9NP74 551 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 BABAM2Q9NXR7 383 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 LCE6AA0A183 80 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 LINC01619G3V211 115 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 OR5H8P0DN80 308 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 LINC00205P59089 165 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 CX3CL1P78423 397 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 INSL4Q14641 139 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 CCDC58Q4VC31 144 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 AWAT2Q6E213 333 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 LIN54Q6MZP7 749 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 GAPTQ8N292 157 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 PGLYRP3Q96LB9 341 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 Q96M66 194 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 SULT4A1Q9BR01 284 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 FUT3P21217 361 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 INSL3P51460 131 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 Q3ZCU0 254 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 ACSM6Q6P461 480 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 LYPD6Q86Y78 171 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 IL1F10Q8WWZ1 152 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 FAAP24Q9BTP7 215 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 SPACA1Q9HBV2 294 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 KIAA1456Q9P272 454 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 ZNF580Q9UK33 172 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 PDCD6O75340 191 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 GPX5O75715 221 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 SC5DO75845 299 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 ATP5HO75947 161 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 NDUFA3O95167 84 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 CT45A6P0DMU7 189 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 CT45A5P0DMU8 189 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 CT45A7P0DMV0 189 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 PLGLAQ15195 96 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 Q499Y3 187 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 C6orf201Q7Z4U5 140 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 Q8N1Y9 231 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 ZNF485Q8NCK3 441 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 NPBQ8NG41 125 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 ABHD14BQ96IU4 210 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 RDH12Q96NR8 316 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 DERL3Q96Q80 235 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 CKLFQ9UBR5 152 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 RRHO14718 337 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 MYL12AP19105 171 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 FSTP19883 344 aa8.6□□□□□ -1.03
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