RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 LYNX1G3V0Z9 82 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 GOSR2O14653 212 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 MPPED1O15442 326 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 SNAPC5O75971 98 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 OR2A4O95047 310 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 C1QBP02746 253 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 LYNX1P0DP58 116 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 CXCL3P19876 107 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 CDKN1AP38936 164 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 C17orf58Q2M2W7 97 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 LYPD2Q6UXB3 125 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 UXS1Q8NBZ7 420 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 ZNF714Q96N38 554 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 OR2A7Q96R45 310 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 GFOD1Q9NXC2 390 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa10.66□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 MYO9AB2RTY4 2548 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 A8MV72 311 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 H0Y980 276 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 HSD17B6O14756 317 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 CLDN1O95832 211 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 RBP4P02753 201 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 OR8U9P0C7N5 309 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 LOXL3P58215 753 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 CYCSP99999 105 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 SLC9A3R2Q15599 337 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 MORN2Q502X0 79 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 HEPN1Q6WQI6 88 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 TCF23Q7RTU1 214 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 C5orf24Q7Z6I8 188 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 TBC1D26Q86UD7 250 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 LGI3Q8N145 548 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 OR52L2PQ8NGH6 319 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 OR8U1Q8NH10 309 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 DMRTB1Q96MA1 342 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 DCTN5Q9BTE1 182 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 CCL28Q9NRJ3 127 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 KCNS2Q9ULS6 477 aa10.65□□□□□ -0.7
NISCH-203ENST00000460759 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa10.65□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 A1L4Q6 167 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 F5H0A9 414 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 IFNA21P01568 189 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 OR5AC1P0C628 307 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 F2RP25116 425 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 PDLIM4P50479 330 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 CD300CQ08708 224 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 FGL1Q08830 312 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 CATR1Q13166 79 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 TMEM187Q14656 261 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 GNMTQ14749 295 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 GSG1LQ6UXU4 331 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 LIAT1Q6ZQX7 453 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 LURAP1LQ8IV03 231 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 RFESDQ8TAC1 157 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 C8orf46Q8TAG6 207 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 UBALD1Q8TB05 177 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 IL22RA2Q969J5 263 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 HYLS1Q96M11 299 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 OR2D2Q9H210 308 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 C19orf12Q9NSK7 152 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 GAB2Q9UQC2 676 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa10.63□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 A0A1W2PPE2 198 aa10.63□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 A0A1W2PR64 198 aa10.63□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 A0A1W2PRV1 198 aa10.63□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 NDUFS8O00217 210 aa10.63□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 PAX1P15863 534 aa10.63□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 UCP1P25874 307 aa10.63□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 ANKRD55Q3KP44 614 aa10.63□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 AVPI1Q5T686 147 aa10.63□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 TMEM200BQ69YZ2 307 aa10.63□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 ZNF66Q6ZN08 573 aa10.63□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 ZNF841Q6ZN19 808 aa10.63□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 NOXA1Q86UR1 476 aa10.63□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 DRAM1Q8N682 238 aa10.63□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 C8orf31Q8N9H6 132 aa10.63□□□□□ -0.71
NISCH-203ENST00000460759 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms