RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 RBBP9O75884 186 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 ARG1P05089 322 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 ZBTB25P24278 435 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 SAA4P35542 130 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 GNG10P50151 68 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF134P52741 427 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 ARPC4P59998 168 aa8.32□□□□□ -1.08
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GARNL3-211ENST00000460176 ACTG1P63261 375 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF45Q02386 682 aa8.32□□□□□ -1.08
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GARNL3-211ENST00000460176 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00311Q8N616 119 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 BEND2Q8NDZ0 799 aa8.32□□□□□ -1.08
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GARNL3-211ENST00000460176 OR4P4Q8NGL7 312 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.32□□□□□ -1.08
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GARNL3-211ENST00000460176 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 A0A1W2PPE3 182 aa8.31□□□□□ -1.08
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GARNL3-211ENST00000460176 CTXN2P0C2S0 81 aa8.31□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 EPHA1P21709 976 aa8.31□□□□□ -1.08
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GARNL3-211ENST00000460176 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.3□□□□□ -1.08
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GARNL3-211ENST00000460176 EHFQ9NZC4 300 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.3□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
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GARNL3-211ENST00000460176 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 M0QYG6 137 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 ST8SIA5O15466 376 aa8.29□□□□□ -1.08
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GARNL3-211ENST00000460176 CD3DP04234 171 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 CSF1P09603 554 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 SRD5A1P18405 259 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 TBPP20226 339 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 AADACP22760 399 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 HTR1DP28221 377 aa8.29□□□□□ -1.08
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