RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRR18Q8N4B5 295 aa7.36□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.36□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.36□□□□□ -1.23
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 DGCR2P98153 550 aa7.35□□□□□ -1.23
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 MORN2Q502X0 79 aa7.35□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.35□□□□□ -1.23
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 TFAP2CQ92754 450 aa7.35□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RHOVQ96L33 236 aa7.35□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KCTD7Q96MP8 289 aa7.35□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.35□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.35□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa7.35□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.35□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 JPT1Q9UK76 154 aa7.35□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.35□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAMP3O60896 148 aa7.34□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HLA-DRB1P01911 266 aa7.34□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR5H8P0DN80 308 aa7.34□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 VDAC1P21796 283 aa7.34□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.34□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.34□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AHSA2Q719I0 299 aa7.34□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.34□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR5M8Q8NGP6 311 aa7.34□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM46BQ96A09 425 aa7.34□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa7.34□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.34□□□□□ -1.23
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 CST11Q9H112 138 aa7.34□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FKBP14Q9NWM8 211 aa7.34□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GHRLQ9UBU3 117 aa7.34□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SCOCQ9UIL1 159 aa7.34□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 UBE2QL1A1L167 161 aa7.33□□□□□ -1.24
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 UBBP0CG47 229 aa7.33□□□□□ -1.24
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 MYF6P23409 242 aa7.33□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CHATP28329 748 aa7.33□□□□□ -1.24
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 INSL4Q14641 139 aa7.33□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.33□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.33□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.33□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RITA1Q96K30 269 aa7.33□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.33□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.33□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 YPEL2Q96QA6 119 aa7.33□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NABP2Q9BQ15 211 aa7.33□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.33□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.33□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.33□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.32□□□□□ -1.24
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