RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	CFHR3	Q02985	330 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	TPBG	Q13641	420 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	TEX38	Q6PEX7	206 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF152	Q8N8N0	203 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	UFD1	Q92890	307 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	P2RX4	Q99571	388 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	GFI1	Q99684	422 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNK15	Q9H427	330 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF580	Q9UK33	172 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC42	Q9Y546	428 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0A6YYD4	124 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	BPNT1	O95861	308 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	MYCNOS	P40205	109 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	SVOP	Q8N4V2	548 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	GALM	Q96C23	342 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	GON7	Q9BXV9	100 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	IGF1	P05019	195 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	SOX6	P35712	828 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	DPF1	Q92782	380 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM203	Q969S6	136 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	NABP2	Q9BQ15	211 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MRPL28-203	ENST00000429738	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	RGS10	O43665	173 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	RGS11	O94810	467 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	ELANE	P08246	267 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	CPE	P16870	476 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	CRHBP	P24387	322 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXE3	Q13461	319 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAM1	Q15629	374 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	NUDT19	A8MXV4	375 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC17A2	O00624	439 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHG4	P01861	327 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	HSMCR30	P0CW71	290 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	ACTB	P60709	375 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	MMD	Q15546	238 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	RAX2	Q96IS3	184 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	RITA1	Q96K30	269 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	SOCS1	O15524	211 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	ARSB	P15848	533 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	OR3A3	P47888	321 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	HSF4	Q9ULV5	492 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	ITGB1BP1	O14713	200 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	ARL6IP5	O75915	188 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	HLA-DRB1	P01911	266 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	VDAC1	P21796	283 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	CNTFR	P26992	372 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMB8	P28062	276 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM50B	P56557	158 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MRPL28-203	ENST00000429738	FABP5	Q01469	135 aa		13.86	□□□□□ -0.19

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