RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 OR1K1Q8NGR3 316 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 UCN2Q96RP3 112 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF665Q9H7R5 613 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 ASCL3Q9NQ33 180 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 DOCK10Q96BY6 2186 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 NMBP08949 121 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC3BQ96PB8 259 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 C5orf42Q9H799 3197 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 CACNA1BQ00975 2339 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 MT-ND6P03923 174 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 SPEM2Q0P670 501 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR35Q9HC97 309 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 HRKO00198 91 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 PSG2P11465 335 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 IFITM3Q01628 133 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB124Q8NES8 71 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 OR8B3Q8NGG8 313 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 OR8B2Q96RD0 313 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 NRTNQ99748 197 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 GPA33Q99795 319 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM38BQ9NVV0 291 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-202ENST00000426333 TANC1Q9C0D5 1861 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 H3BVH4 76 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 MGPP08493 103 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 WNT5AP41221 380 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 RUNX1Q01196 453 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 GHITMQ9H3K2 345 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 TUBD1Q9UJT1 453 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 CACNA1HO95180 2353 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 MMDQ15546 238 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A40Q8TBP6 338 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 RABAC1Q9UI14 185 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 BGLAPP02818 100 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 CCL3P10147 92 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 PAFAH1B2P68402 229 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 RTP5Q14D33 572 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 CLN8Q9UBY8 286 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 CCL4P13236 92 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 MDKP21741 143 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNMB1Q16558 191 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 VAX1Q5SQQ9 334 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 OR1N2Q8NGR9 330 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 TXNDC17Q9BRA2 123 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 TREM2Q9NZC2 230 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 VWA8A3KMH1 1905 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEA5P43359 124 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL31P62899 125 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 C3AR1Q16581 482 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF738Q8NE65 137 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 CT55Q8WUE5 264 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM204Q9BSN7 226 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNK7Q9Y2U2 307 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 SCN5AQ14524 2016 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 NMUP48645 174 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 AESQ08117 197 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF502Q8TBZ5 544 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 TNFSF14O43557 240 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 TCF21O43680 179 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 PITX3O75364 302 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 HYPMO75409 117 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 GABRA6Q16445 453 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 GUCA2BQ16661 112 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXW9Q5XUX1 488 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 RHOVQ96L33 236 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms