RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 FDCSPQ8NFU4 85 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 OR51H1Q8NH63 302 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 IL1F10Q8WWZ1 152 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 MALSU1Q96EH3 234 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 DNAJC13O75165 2243 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 C1orf196B1AJZ1 125 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 SYNGR2O43760 224 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 IGKV1-39P01597 117 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 IGKV1D-39P04432 117 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 CCL11P51671 97 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 ZNF506Q5JVG8 444 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 IGFL2Q6UWQ7 119 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 SLC25A40Q8TBP6 338 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.07■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 M0R036 132 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 SIRPB1O00241 398 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 C1orf174Q8IYL3 243 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 OR10G4Q8NGN3 311 aa20.06■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 PSG7Q13046 419 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 ZNF585BQ52M93 769 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 SLC35E4Q6ICL7 350 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 PRR7Q8TB68 274 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 KCNIP1Q9NZI2 227 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 USP24Q9UPU5 2620 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 CDIPTO14735 213 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 CELA3BP08861 270 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 COX5AP20674 150 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 EPHA1P21709 976 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 TMEM217Q8N7C4 229 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 CACNG5Q9UF02 275 aa20.05■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 AQP7O14520 342 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 CEACAM4O75871 244 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 IGKV1-5P01602 117 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 IGKV3-15P01624 115 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 AGAP20933 346 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 TMPRSS3P57727 454 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 KHDC3LQ587J8 217 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 Q6ZRM9 215 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 MMP24Q9Y5R2 645 aa20.04■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 HAND1O96004 215 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 SRP19P09132 144 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 HBG1P69891 147 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 HBG2P69892 147 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 CCL20P78556 96 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 CD300LFQ8TDQ1 290 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 A0A087WWC5 75 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 GPR37O15354 613 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 CEACAM6P40199 344 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 SERF2P84101 59 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 ETV3LQ6ZN32 361 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 DRAM1Q8N682 238 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 CXXC4Q9H2H0 198 aa20.03■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 ZNF645Q8N7E2 425 aa20.02■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 SCGB1C1Q8TD33 95 aa20.02■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 RARRES2Q99969 163 aa20.02■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 PSENENQ9NZ42 101 aa20.02■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa20.02■□□□□ 0.8
PMS1-205ENST00000409985 ESPL1Q14674 2120 aa20.02■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 TMEM8BA6NDV4 472 aa20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 OOEPA6NGQ2 149 aa20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 K7EM74 188 aa20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 PPIHO43447 177 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 OR13C7P0DN81 318 aa20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 KITLGP21583 273 aa20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 IQCF2Q8IXL9 164 aa20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 SFT2D1Q8WV19 159 aa20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 GALMQ96C23 342 aa20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 OBP2BQ9NPH6 170 aa20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 ZNF98A6NK75 572 aa20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 IFNL4K9M1U5 179 aa20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 PAX5Q02548 391 aa20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 TBR1Q16650 682 aa20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 CLDND2Q8NHS1 167 aa20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 MBD3L1Q8WWY6 194 aa20.01■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 A0A1B0GWJ7 208 aa20■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 LYZL6O75951 148 aa20■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 RAB5AP20339 215 aa20■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 HOXC12P31275 282 aa20■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 UCNP55089 124 aa20■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 RUNX1Q01196 453 aa20■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 PMS2P11Q13670 270 aa20■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 ICAM4Q14773 271 aa20■□□□□ 0.79
PMS1-205ENST00000409985 C1QL4Q86Z23 238 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms