RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 SP6Q3SY56 376 aa16.58■□□□□ 0.25
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ODC1-202ENST00000405333 C11orf42Q8N5U0 333 aa16.55■□□□□ 0.24
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ODC1-202ENST00000405333 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
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ODC1-202ENST00000405333 BTNL3Q6UXE8 466 aa16.54■□□□□ 0.24
ODC1-202ENST00000405333 CT45A3Q8NHU0 189 aa16.54■□□□□ 0.24
ODC1-202ENST00000405333 PHB2Q99623 299 aa16.54■□□□□ 0.24
ODC1-202ENST00000405333 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
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ODC1-202ENST00000405333 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.24
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ODC1-202ENST00000405333 HEPN1Q6WQI6 88 aa16.53■□□□□ 0.24
ODC1-202ENST00000405333 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
ODC1-202ENST00000405333 OR51H1Q8NH63 302 aa16.53■□□□□ 0.24
ODC1-202ENST00000405333 LPAR3Q9UBY5 353 aa16.53■□□□□ 0.24
ODC1-202ENST00000405333 ADAP1O75689 374 aa16.53■□□□□ 0.24
ODC1-202ENST00000405333 IGHV2-5P01817 119 aa16.53■□□□□ 0.24
ODC1-202ENST00000405333 LY6G6FQ5SQ64 297 aa16.53■□□□□ 0.24
ODC1-202ENST00000405333 CMTM1Q8IZ96 169 aa16.53■□□□□ 0.24
ODC1-202ENST00000405333 ZNF645Q8N7E2 425 aa16.53■□□□□ 0.24
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