RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 SELENOTP62341 195 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 SLC38A11Q08AI6 406 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 LINC01551Q86U37 167 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 OR10G3Q8NGC4 313 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 OR1F12Q8NHA8 337 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 TECTBQ96PL2 329 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 MSL2Q9HCI7 577 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 ATP23Q9Y6H3 246 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 IGKV1-39P01597 117 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 IGKV1D-39P04432 117 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 ADMP35318 185 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 RAB7AP51149 207 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 CLDN15P56746 228 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 BATFQ16520 125 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 ANKRD37Q7Z713 158 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 OR10V1Q8NGI7 309 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 VAMP8Q9BV40 100 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 PAM16Q9Y3D7 125 aa18.6■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 KNL1Q8NG31 2342 aa18.59■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa18.59■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 HS3ST1O14792 307 aa18.59■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 CD33P20138 364 aa18.59■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 OR51H1Q8NH63 302 aa18.59■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 TMEM9BQ9NQ34 198 aa18.59■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 ELOVL5Q9NYP7 299 aa18.59■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 TMPRSS2O15393 492 aa18.59■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 NPPCP23582 126 aa18.59■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 PLA2G5P39877 138 aa18.59■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 PCSK4Q6UW60 755 aa18.59■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 BATF2Q8N1L9 274 aa18.59■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 C11orf42Q8N5U0 333 aa18.59■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 ULBP2Q9BZM5 246 aa18.59■□□□□ 0.57
CLDN5-201ENST00000403084 OR6C6A6NF89 314 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 LINC00310P59036 64 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 PIGCQ92535 297 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 PAGE4O60829 102 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 SPANXN5Q5MJ07 72 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 FADS6Q8N9I5 356 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 OR5T1Q8NG75 326 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 CHD9Q3L8U1 2897 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 NPIPA2E9PIF3 369 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 NPIPA3F8WFD2 350 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 IGKV1-5P01602 117 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 TFPI2P48307 235 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 OR10G9Q8NGN4 311 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 OR10G7Q8NGN6 311 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 LMX1AQ8TE12 382 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 CHRNB4P30926 498 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 CDKN1AP38936 164 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 FAM69BQ5VUD6 431 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 OR2W1Q9Y3N9 320 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 VAMP5O95183 116 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 COMPP49747 757 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 SLC35E1Q96K37 410 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 WNT5BQ9H1J7 359 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 GRIFINA4D1Z8 144 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 BCL3P20749 454 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 OR1K1Q8NGR3 316 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 HSPB9Q9BQS6 159 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 WNT16Q9UBV4 365 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 C11orf94C9JXX5 98 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 RBX1P62877 108 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 TCF23Q7RTU1 214 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 LRP5LA4QPB2 252 aa18.54■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 TDGF1P13385 188 aa18.54■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 LHX2P50458 406 aa18.54■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 COTL1Q14019 142 aa18.54■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 VN1R17PQ8TDU5 208 aa18.54■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 TNFSF11O14788 317 aa18.54■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 MPLP40238 635 aa18.54■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 FGF12P61328 243 aa18.54■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 ZIC4Q8N9L1 334 aa18.54■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 SGMS2Q8NHU3 365 aa18.54■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa18.54■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 MED12Q93074 2177 aa18.54■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 MSMO1Q15800 293 aa18.53■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 OR8G2PQ6IF36 304 aa18.53■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 OR5P3Q8WZ94 311 aa18.53■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 UCN2Q96RP3 112 aa18.53■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa18.53■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 A0A1W2PPC4 97 aa18.53■□□□□ 0.56
CLDN5-201ENST00000403084 PDE6DO43924 150 aa18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms