RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 HSD17B6O14756 317 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 TXNL1O43396 289 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 DIRAS3O95661 229 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 TMBIM6P55061 237 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 GNG2P59768 71 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2NLQ5JXB2 153 aa12.39□□□□□ -0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A38Q96DW6 304 aa12.39□□□□□ -0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC23A1Q9UHI7 598 aa12.39□□□□□ -0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 CEACAM6P40199 344 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF260Q3ZCT1 412 aa12.38□□□□□ -0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 C16orf82Q7Z2V1 217 aa12.38□□□□□ -0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM235A6NFC5 223 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 ITGB1BP1O14713 200 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR10J5Q8NHC4 309 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PPI3 338 aa12.36□□□□□ -0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 M0QZK8 103 aa12.36□□□□□ -0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 DRAM1Q8N682 238 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 C16orf95Q9H693 158 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 AUNIPQ9H7T9 357 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 PIPOXQ9P0Z9 390 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 COMMD3Q9UBI1 195 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB29O14966 203 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 APOA1P02647 267 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 CBX5P45973 191 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 REG1BP48304 166 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 RELBQ01201 579 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 HES1Q14469 280 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM69Q5SWH9 247 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 C11orf88Q6PI97 169 aa12.35□□□□□ -0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 C5orf24Q7Z6I8 188 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM219Q86XT9 240 aa12.35□□□□□ -0.43
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PGGT1B-202ENST00000379615 S1PR3Q99500 378 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 GINS4Q9BRT9 223 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 CABLES2Q9BTV7 478 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 BET1O15155 118 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 CHST1O43916 411 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2F2O95006 317 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 GSTT2P0CG29 244 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 GSTT2BP0CG30 244 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 MDKP21741 143 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 CD24P25063 80 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 CD1BP29016 333 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM71F2Q6NXP2 309 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 Q6ZSV7 163 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 IZUMO1Q8IYV9 350 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2T6Q8NHC8 308 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-202ENST00000379615 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
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