RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 NKX2-6A6NCS4 301 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 Q6AWC8 147 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 GLRX2Q9NS18 164 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 LINC00869P0C866 280 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FAM78AQ5JUQ0 283 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 SEC11AP67812 179 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 IMMP2LQ96T52 175 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 A0A096LPE4 126 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1W2PPZ6 126 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF735P0CB33 412 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 MAS1LP35410 378 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 VN1R2Q8NFZ6 395 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 C5orf30Q96GV9 206 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 PLPP3O14495 311 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 C10orf128Q5T292 105 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 SFXN3Q9BWM7 321 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM189A5PLL7 270 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 CXCL12P48061 93 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 MPLP40238 635 aa7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 UBE2CO00762 179 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 S1PR2O95136 353 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 GNG7O60262 68 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FAM157BP0CG42 384 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FOXB1Q99853 325 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1B0GWB2 263 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 SRIP30626 198 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 GALNSP34059 522 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 HERPUD1Q15011 391 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF77Q15935 545 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 PARLQ9H300 379 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 CHODLQ9H9P2 273 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FAM90A10PA6NDY2 464 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FAM90A18PA6NE21 464 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 C17orf51A8MQB3 221 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FAM90A14PP0C7W9 464 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 OR4X1Q8NH49 305 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 M0R1B8 84 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 ATP5LO75964 103 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 GZMHP20718 246 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FOXF1Q12946 379 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 CEACAM16Q2WEN9 425 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 SLC6A13Q9NSD5 602 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 A0A0U1RQV5 110 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 OR2A4O95047 310 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 OR2A7Q96R45 310 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 EML2O95834 649 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 Q8WTZ3 238 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 SCNM1Q9BWG6 230 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 TINAGQ9UJW2 476 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 FREM1Q5H8C1 2179 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 PRRG2O14669 202 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM50AO95807 157 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 PSG9Q00887 426 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 INSL4Q14641 139 aa7.22□□□□□ -1.25
PKHD1-201ENST00000340994 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms