RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 CLEC18AA5D8T8 446 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 LEUTXA8MZ59 168 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 SERPINE2P07093 398 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 CD3EP07766 207 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 NMBP08949 121 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 TEX36Q5VZQ5 186 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC28AQ8IWP9 274 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 CLEC18CQ8NCF0 446 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 PLEKHA2Q9HB19 425 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 CYTL1Q9NRR1 136 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 NBASA2RRP1 2371 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 DYSFO75923 2080 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 ARID1AO14497 2285 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 ADAM20O43506 726 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
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HOXD8-201ENST00000313173 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 MSMO1Q15800 293 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 EGLN1Q9GZT9 426 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 OR2D2Q9H210 308 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC30A6NM36 301 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 RNF212BA8MTL3 300 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 GALNT11Q8NCW6 608 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 RFESDQ8TAC1 157 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 LINC01560Q8TB33 94 aa22.33■■□□□ 1.16
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HOXD8-201ENST00000313173 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa22.33■■□□□ 1.16
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HOXD8-201ENST00000313173 RELNP78509 3460 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 NEUROG1Q92886 237 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 C14orf79Q96F83 325 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 GAFA1Q96PS6 74 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF665Q9H7R5 613 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa22.32■■□□□ 1.16
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HOXD8-201ENST00000313173 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 DEFB108BQ8NET1 73 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 ABHD14BQ96IU4 210 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 SAP30LQ9HAJ7 183 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 DCAF16Q9NXF7 216 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 OR6C3Q9NZP0 311 aa22.31■■□□□ 1.16
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HOXD8-201ENST00000313173 TAAR5O14804 337 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 SELLP14151 372 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 GRNP28799 593 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF788Q6ZQV5 615 aa22.31■■□□□ 1.16
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HOXD8-201ENST00000313173 FAM234AQ9H0X4 552 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A32Q9H2D1 315 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 RNF150Q9ULK6 438 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV3-43DP0DP04 118 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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HOXD8-201ENST00000313173 JPT1Q9UK76 154 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 RRASP10301 218 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 C5orf30Q96GV9 206 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 DYNLRB1Q9NP97 96 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 CACNA1BQ00975 2339 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1B0GW55 424 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 SHOXO15266 292 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 GYPAP02724 150 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 DUX4L2P0CJ85 424 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 DUX4L3P0CJ86 424 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 DUX4L4P0CJ87 422 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 DUX4L5P0CJ88 424 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 DUX4L6P0CJ89 424 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 DUX4L7P0CJ90 424 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 P2RY1P47900 373 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 DMBX1Q8NFW5 382 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 CCL13Q99616 98 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 DUX4Q9UBX2 424 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 RNF115Q9Y4L5 304 aa22.29■■□□□ 1.16
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HOXD8-201ENST00000313173 F2RL2O00254 374 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV1-39P01597 117 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV1D-39P04432 117 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A6P12236 298 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 CDSNQ15517 529 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF585BQ52M93 769 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 BAP18Q8IXM2 172 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 FAM216AQ8WUB2 273 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 LGALS8O00214 317 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 M6PRP20645 277 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 PDZD9Q8IXQ8 264 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 C1orf87Q8N0U7 546 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 EDARADDQ8WWZ3 215 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
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