RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM90A16PA6NEW6 464 aa11.69□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa11.69□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa11.69□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM90A7PA6NKC0 464 aa11.69□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 CEACAM18A8MTB9 384 aa11.69□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM90A22PA8MWA6 464 aa11.69□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM90A12PA8MX19 464 aa11.69□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa11.69□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa11.69□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM90A15PP0C7V4 464 aa11.69□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM90A13PP0C7W8 464 aa11.69□□□□□ -0.54
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PDGFRB-201ENST00000261799 FAM90A24PP0C7X0 464 aa11.69□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 SMIM10L1P0DMW3 83 aa11.69□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 SAXO1Q8IYX7 474 aa11.69□□□□□ -0.54
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PDGFRB-201ENST00000261799 SCMH1Q96GD3 660 aa11.69□□□□□ -0.54
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PDGFRB-201ENST00000261799 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
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PDGFRB-201ENST00000261799 TMEM116Q8NCL8 245 aa11.68□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 SSMEM1Q8WWF3 244 aa11.68□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
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PDGFRB-201ENST00000261799 FXYD3Q14802 87 aa11.68□□□□□ -0.54
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PDGFRB-201ENST00000261799 CHAC2Q8WUX2 184 aa11.68□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 MYO10Q9HD67 2058 aa11.68□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 A0A0B4J293 547 aa11.68□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 ADAM10O14672 748 aa11.68□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNHIT1O43257 154 aa11.68□□□□□ -0.54
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PDGFRB-201ENST00000261799 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa11.68□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 TTRP02766 147 aa11.68□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 TGFBR1P36897 503 aa11.68□□□□□ -0.54
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PDGFRB-201ENST00000261799 WNT5BQ9H1J7 359 aa11.67□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa11.67□□□□□ -0.54
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PDGFRB-201ENST00000261799 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa11.67□□□□□ -0.54
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PDGFRB-201ENST00000261799 SLC35E3Q7Z769 313 aa11.67□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 IGHMP01871 453 aa11.66□□□□□ -0.54
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PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF429Q86V71 674 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 NPPCP23582 126 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 COL8A1P27658 744 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 CRYBB2P43320 205 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 BTN1A1Q13410 526 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 VWCEQ96DN2 955 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 SLC25A17O43808 307 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 INSL4Q14641 139 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 HCP5Q6MZN7 132 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 PAXXQ9BUH6 204 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa11.66□□□□□ -0.54
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