RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 TRDCB7Z8K6 153 aa17.83■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 MNDAP41218 407 aa17.83■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 REG1BP48304 166 aa17.83■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 HACD4Q5VWC8 232 aa17.83■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 THNSL2Q86YJ6 484 aa17.83■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 OR8H3Q8N146 312 aa17.83■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 MAFIPQ8WZ33 124 aa17.83■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 RAB18Q9NP72 206 aa17.83■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 OR1A1Q9P1Q5 309 aa17.83■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GUS0 222 aa17.82■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 KIR2DS4P43632 304 aa17.82■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 PROK1P58294 105 aa17.82■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP10-3P60369 221 aa17.82■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP17.82■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZS46 218 aa17.82■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 GPR141Q7Z602 305 aa17.82■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 OR56B4Q8NH76 319 aa17.82■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 AGMATQ9BSE5 352 aa17.82■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa17.82■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 ABCG5Q9H222 651 aa17.82■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 SIGLEC9Q9Y336 463 aa17.82■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 TMEM235A6NFC5 223 aa17.81■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 SSX5O60225 188 aa17.81■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 SCGNO76038 276 aa17.81■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 GSTT2P0CG29 244 aa17.81■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 GSTT2BP0CG30 244 aa17.81■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 BLCAPP62952 87 aa17.81■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 EBI3Q14213 229 aa17.81■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 ARL6IP1Q15041 203 aa17.81■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZS49 121 aa17.81■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 C3orf56Q8N813 242 aa17.81■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 TOLLIPQ9H0E2 274 aa17.81■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 IFI27L2Q9H2X8 130 aa17.81■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 ZNF702PQ9H963 129 aa17.81■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 SLC23A1Q9UHI7 598 aa17.81■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 RNF114Q9Y508 228 aa17.81■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 RGS11O94810 467 aa17.8■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 AMY1AP04745 511 aa17.8■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 AMY2AP04746 511 aa17.8■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 CEACAM6P40199 344 aa17.8■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 ARHGDIBP52566 201 aa17.8■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 ARFRP1Q13795 201 aa17.8■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 IGSF11Q5DX21 431 aa17.8■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 IZUMO1Q8IYV9 350 aa17.8■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 LYG1Q8N1E2 194 aa17.8■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 Q8N2B8 174 aa17.8■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 CAPSLQ8WWF8 208 aa17.8■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 ZNF251Q9BRH9 671 aa17.8■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 ITGB1BP1O14713 200 aa17.79■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 FABP7O15540 132 aa17.79■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 LANCL1O43813 399 aa17.79■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 DTYMKP23919 212 aa17.79■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 IL3RAP26951 378 aa17.79■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa17.79■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 OR4A4PQ8NGN8 299 aa17.79■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa17.79■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 WFDC12Q8WWY7 111 aa17.79■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 CABLES2Q9BTV7 478 aa17.79■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa17.79■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 TRAV18A0A075B6X5 111 aa17.78■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 A0A0A6YYH2 397 aa17.78■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa17.78■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 A6NJ64 397 aa17.78■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 ST8SIA5O15466 376 aa17.78■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 OR2F2O95006 317 aa17.78■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB25P24278 435 aa17.78■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 RPL5P46777 297 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 OR3A3P47888 321 aa17.78■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa17.78■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 C16orf82Q7Z2V1 217 aa17.78■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 MOB3BQ86TA1 216 aa17.78■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 OR2AK2Q8NG84 335 aa17.78■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A33Q9BSK2 321 aa17.78■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa17.77■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 PROP1O75360 226 aa17.77■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 FAM106CPP0CH98 169 aa17.77■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 KIR2DS1Q14954 304 aa17.77■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa17.77■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 Q8N6K4 173 aa17.77■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 OR4C13Q8NGP0 309 aa17.77■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 DCSTAMPQ9H295 470 aa17.77■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 AUNIPQ9H7T9 357 aa17.77■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 SERTAD4Q9NUC0 356 aa17.77■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 XRCC3O43542 346 aa17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1D-33P01593 117 aa17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1-33P01594 117 aa17.76■□□□□ 0.43
SYF2-201ENST00000236273 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms