RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 HSPA12AO43301 675 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 LANCL1O43813 399 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 LY6G6DO95868 133 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 PMP2P02689 132 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CSF1P09603 554 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 NAT1P18440 290 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 PRTN3P24158 256 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ZBTB25P24278 435 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 HRH1P35367 487 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 GNG10P50151 68 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 HTD2P86397 168 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 KLRD1Q13241 179 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 LSAMPQ13449 338 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF846Q147U1 533 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 HERPUD1Q15011 391 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CDK10Q15131 360 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 UTF1Q5T230 341 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 STEAP3Q658P3 488 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 PNKDQ8N490 385 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TSC22D3Q99576 134 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 GINS4Q9BRT9 223 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 GNG12Q9UBI6 72 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 JPT1Q9UK76 154 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CREBBPQ92793 2442 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PPE3 182 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PRD5 423 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PRF3 423 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PRM7 423 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 J3QRK9 145 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 M0QYG6 137 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 WIPF1O43516 503 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 RGS11O94810 467 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CD3DP04234 171 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CTXN2P0C2S0 81 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CEACAM6P40199 344 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR3A3P47888 321 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 RFX2P48378 723 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 INPP1P49441 399 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 LOXL3P58215 753 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TAS2R46P59540 309 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TAS2R19P59542 299 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 BAK1Q16611 211 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ACTBL2Q562R1 376 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TRIQKQ629K1 86 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 HCP5Q6MZN7 132 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TNFRSF14Q92956 283 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TRIM63Q969Q1 353 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 UPRTQ96BW1 309 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 EHFQ9NZC4 300 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF69Q9UC07 566 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 MED13LQ71F56 2210 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 HIVEP1P15822 2718 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 A0A087X0M5 115 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 175.5 ms