RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611117.1

TTC28-AS1_2.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_2, Length 157 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ANP32EQ9BTT0 268 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 C11orf1Q9H5F2 150 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NMRK1Q9NWW6 199 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NINLQ9Y2I6 1382 aa-0.83□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 A0A1W2PQD3 144 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RBFOX3A6NFN3 312 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 H7C2Y5 167 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 M0R1B8 84 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CXCL11O14625 94 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NCR3O14931 201 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ORC5O43913 435 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HSBP1O75506 76 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CD24P25063 80 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DNAJC3Q13217 504 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PDK2Q15119 407 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MAPK14Q16539 360 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRAMEF20Q5VT98 475 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FAM173BQ6P4H8 233 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SSX9Q7RTT3 188 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PIH1D2Q8WWB5 315 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NRGNQ92686 78 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TAMM41Q96BW9 452 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OPALINQ96PE5 141 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SERPINI1Q99574 410 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 APOL4Q9BPW4 351 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ANKHQ9HCJ1 492 aa-0.84□□□□□ -2.54
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR5K4A6NMS3 321 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CLDN25C9JDP6 229 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 H0Y8G0 127 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TMEM250H0YL14 139 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 BHLHE40O14503 412 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PHYHO14832 338 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR2T1O43869 369 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SLC2A1P11166 492 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DESP17661 470 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PYCR1P32322 319 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SULT1E1P49888 294 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 AQP4P55087 323 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RHOAP61586 193 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TMEM249Q2WGJ8 235 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ALKBH6Q3KRA9 238 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR9I1Q8NGQ6 314 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR13C2Q8NGS9 318 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FAM81AQ8TBF8 368 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SUN5Q8TC36 379 aa-0.85□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 A0A1B0GXF2 115 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 J3QLI3 93 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SLC17A3O00476 420 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IGHV1-69P01742 117 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KDELR1P24390 212 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ATP6V0CP27449 155 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CD79BP40259 229 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HNMTP50135 292 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RAB2AP61019 212 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ATP6V0D1P61421 351 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RAD51Q06609 339 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PDGFRLQ15198 375 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CEACAM16Q2WEN9 425 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 C8orf31Q8N9H6 132 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GATD1Q8NB37 220 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR4P4Q8NGL7 312 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR4C6Q8NH72 309 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GALMQ96C23 342 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ARMC7Q9H6L4 198 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DIABLOQ9NR28 239 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RAB20Q9NX57 234 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GMEB1Q9Y692 573 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ADAMTSL3P82987 1691 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FLNCQ14315 2725 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PTPRSQ13332 1948 aa-0.86□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 B4DEV8 164 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ITGB1BP1O14713 200 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KLRC4O43908 158 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NPPCP23582 126 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MP68P56378 58 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TAS2R20P59543 309 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GABARAPL2P60520 117 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 XRCC4Q13426 336 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HES3Q5TGS1 186 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 EBLN2Q6P2I7 272 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LYZL1Q6UWQ5 148 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FAM122BQ7Z309 247 aa-0.87□□□□□ -2.55
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa-0.87□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms