RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 ADAP1O75689 374 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 DFFBO76075 338 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 TNFSF15O95150 251 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 NDUFB8O95169 186 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 PPYP01298 95 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 HEXAP06865 529 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 FAM157CP0CG43 387 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 LIPCP11150 499 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 CD59P13987 128 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 KLK2P20151 261 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 VDAC1P21796 283 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 OPRM1P35372 400 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRM-215ENST00000583289 KCNJ3P48549 501 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM33P57088 247 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 VAMP2P63027 116 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRM-215ENST00000583289 PMS2P11Q13670 270 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF273Q14593 569 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRM-215ENST00000583289 BEX5Q5H9J7 111 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRM-215ENST00000583289 SLC22A25Q6T423 547 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRM-215ENST00000583289 TUSC5Q8IXB3 177 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 FAM58AQ8N1B3 248 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM251Q8N6I4 163 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 CLEC18CQ8NCF0 446 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 MDS2Q8NDY4 140 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 BHLHE23Q8NDY6 225 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 OR2AE1Q8NHA4 323 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 OR10J5Q8NHC4 309 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRM-215ENST00000583289 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
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PTPRM-215ENST00000583289 POM121L2Q96KW2 1035 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 RAB40CQ96S21 281 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRM-215ENST00000583289 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 WDR13Q9H1Z4 485 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRM-215ENST00000583289 KCNIP1Q9NZI2 227 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 NDRG3Q9UGV2 375 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 RNF150Q9ULK6 438 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 KPTNQ9Y664 436 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 DOCK10Q96BY6 2186 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
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PTPRM-215ENST00000583289 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 A0A1W2PPB8 328 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 A0A1W2PRS3 328 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 LNP1A1A4G5 178 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 SLC22A20A6NK97 555 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 KIR3DP1A8MWS1 328 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 H0Y980 276 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 J3QT63 122 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 LGALS8O00214 317 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRM-215ENST00000583289 IGKV1D-12P01611 117 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRM-215ENST00000583289 OR5AC1P0C628 307 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 DANCRP0C864 163 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 CCNOP22674 350 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 UCP1P25874 307 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 PTGER4P35408 488 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 MAGEA5P43359 124 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 GPM6AP51674 278 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-215ENST00000583289 ARHGDIBP52566 201 aa3.82□□□□□ -1.8
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