RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574592.5

CLUAP1-208, Transcript of clusterin associated protein 1, human

TSL 3

Gene CLUAP1, Length 726 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLUAP1-208	ENST00000574592	SC5D	O75845	299 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	CD1A	P06126	327 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	GLA	P06280	429 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	FUT3	P21217	361 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	VHL	P40337	213 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	ZNF134	P52741	427 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	RAB25	P57735	213 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	LYPD6	Q86Y78	171 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	FAM46B	Q96A09	425 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	DUX3	Q96PT4	197 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	PDCD6	O75340	191 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	GPR50	Q13585	617 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	CST11	Q9H112	138 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	LANCL1	O43813	399 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	VDAC1	P21796	283 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	SOX6	P35712	828 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	LSAMP	Q13449	338 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	GNMT	Q14749	295 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	STEAP3	Q658P3	488 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	RAX2	Q96IS3	184 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	CYYR1	Q96J86	154 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	GHRL	Q9UBU3	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592		H0YHG0	523 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	CCL24	O00175	119 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	F2RL1	P55085	397 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	FOXE3	Q13461	319 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	DEFB136	Q30KP8	78 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	MORN2	Q502X0	79 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	OR8U1	Q8NH10	309 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	JPT1	Q9UK76	154 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLUAP1-208	ENST00000574592	ELANE	P08246	267 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	UBB	P0CG47	229 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	MYF6	P23409	242 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	MMD	Q15546	238 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	VCX	Q9H320	206 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	RGS11	O94810	467 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	HTD2	P86397	168 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	DGCR2	P98153	550 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	CFHR3	Q02985	330 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	CD69	Q07108	199 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	INSL4	Q14641	139 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	RNF152	Q8N8N0	203 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	TMED9	Q9BVK6	235 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	MND1	Q9BWT6	205 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	IGHG4	P01861	327 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	IGF1	P05019	195 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	OR5H8	P0DN80	308 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	VSIG8	P0DPA2	414 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	CHAT	P28329	748 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLUAP1-208	ENST00000574592	ACTB	P60709	375 aa		13.56	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms