RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569899.5

GDE1-205, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 4

Gene GDE1, Length 1,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-205ENST00000569899 BCAP31P51572 246 aa8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 FXYD4P59646 89 aa8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 CADM3Q8N126 398 aa8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 TERB2Q8NHR7 220 aa8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 RAB1CQ92928 201 aa8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 TOMM40LQ969M1 308 aa8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 TIMD4Q96H15 378 aa8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 NARFLQ9H6Q4 476 aa8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 C19orf12Q9NSK7 152 aa8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 X6R8D5 127 aa8.26□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 FUOMA2VDF0 154 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 NUDT19A8MXV4 375 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 C15orf65H3BRN8 121 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 NDUFB3O43676 98 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 NDUFA2O43678 99 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 DHFRP00374 187 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 PGAM2P15259 253 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 PI3P19957 117 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 RAG2P55895 527 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 KRTAP10-9P60411 292 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 HERV-K104P61576 105 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 GNMTQ14749 295 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 ARL11Q969Q4 196 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 MOB3AQ96BX8 217 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 LURAP1Q96LR2 239 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 ARID1AO14497 2285 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 C7orf66A4D0T2 115 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 TUSC2O75896 110 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 PPYP01298 95 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 CTXN2P0C2S0 81 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 IL2RGP31785 369 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 MECP2P51608 486 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 ZNF273Q14593 569 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 LTC4SQ16873 150 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 LDLRAD3Q86YD5 345 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 OR52B4Q8NGK2 314 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 RFESDQ8TAC1 157 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 C5orf66Q9H5L9 145 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 CALYQ9NYX4 217 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 ZNF69Q9UC07 566 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 ZNF221Q9UK13 617 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 A0A0A6YYJ9 748 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 FAM172BPA6NC97 362 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 SPINT2O43291 252 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 HSPA12AO43301 675 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 DIRAS3O95661 229 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 CCL3L1P16619 93 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 OMGP23515 440 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 TMEM33P57088 247 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 RPL31P62899 125 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 CBX3Q13185 183 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 MLANAQ16655 118 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 CR1LQ2VPA4 569 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 FAM185AQ8N0U4 392 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 SPICQ8N5J4 248 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 OR10V1Q8NGI7 309 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 TMEM230Q96A57 120 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 GALMQ96C23 342 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 PERPQ96FX8 193 aa8.24□□□□□ -1.09
GDE1-205ENST00000569899 OR8B2Q96RD0 313 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms