RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566121.1

CMTM3-212, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-212ENST00000566121 FOXE3Q13461 319 aa11.95□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 RCN1Q15293 331 aa11.95□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 LTC4SQ16873 150 aa11.95□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 MORN2Q502X0 79 aa11.95□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 MOB3BQ86TA1 216 aa11.95□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 NEK7Q8TDX7 302 aa11.95□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 CCDC107Q8WV48 283 aa11.95□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 YPEL2Q96QA6 119 aa11.95□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 SELENOIQ9C0D9 397 aa11.95□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 JPT1Q9UK76 154 aa11.95□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 BPNT1O95861 308 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 IGHG4P01861 327 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 CDK1P06493 297 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 RANBP1P43487 201 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 CFHR3Q02985 330 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 HNF4GQ14541 408 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 KIR2DS1Q14954 304 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 FAM71F2Q6NXP2 309 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 ZNF329Q86UD4 541 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 ZNF695Q8IW36 515 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 ZFP41Q8N8Y5 198 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 MND1Q9BWT6 205 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 TM2D1Q9BX74 207 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 VCXQ9H320 206 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 TAF9BQ9HBM6 251 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 KCNIP1Q9NZI2 227 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 GNG12Q9UBI6 72 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 A0A1W2PPE3 182 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 ITGB1BP1O14713 200 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 RRP9O43818 475 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 RGS11O94810 467 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 MAS1P04201 325 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 OR5H8P0DN80 308 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 ACSM3Q53FZ2 586 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 GLT8D1Q68CQ7 371 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 ZNF880Q6PDB4 577 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 KCNG3Q8TAE7 436 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 RASL11BQ9BPW5 248 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 DCLRE1BQ9H816 532 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 ISYNA1Q9NPH2 558 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 A0A1W2PPK0 400 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 K7EIL1 84 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 SLC22A1O15245 554 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 SLC31A2O15432 143 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 NAPSAO96009 420 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 SRMP19623 302 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 CHATP28329 748 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP10-11P60412 298 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 QRFPP83859 136 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 LSAMPQ13449 338 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 AHSA2Q719I0 299 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 LRRTM1Q86UE6 522 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 OR4K15Q8NH41 348 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 OR1L1Q8NH94 360 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 MYOZ3Q8TDC0 251 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 DPF1Q92782 380 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 BANF2Q9H503 90 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 OR2S2Q9NQN1 319 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.91□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 LINC01548A6NM66 108 aa11.91□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 UCHL1P09936 223 aa11.91□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 VSIG8P0DPA2 414 aa11.91□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 SOX6P35712 828 aa11.91□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 REG1BP48304 166 aa11.91□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 IRF3Q14653 427 aa11.91□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 SPHARQ15513 63 aa11.91□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 HMGN3Q15651 99 aa11.91□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa11.91□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 ODF3L1Q8IXM7 274 aa11.91□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 FAM89BQ8N5H3 189 aa11.91□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 GALMQ96C23 342 aa11.91□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 DUSP21Q9H596 190 aa11.91□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 MGAT4AQ9UM21 535 aa11.91□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa11.9□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa11.9□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 ERICH4A6NGS2 130 aa11.9□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 TMEM14DPA8MWL7 114 aa11.9□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 RAMP3O60896 148 aa11.9□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 HLA-DRB1P01911 266 aa11.9□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 IGHV3-43DP0DP04 118 aa11.9□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 PSMB8P28062 276 aa11.9□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 RUNX1Q01196 453 aa11.9□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 TPBGQ13641 420 aa11.9□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 TRAM1Q15629 374 aa11.9□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 NPBQ8NG41 125 aa11.9□□□□□ -0.5
CMTM3-212ENST00000566121 OR8U1Q8NH10 309 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.9 ms