RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556470.1

PPP4R4-205, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, human

TSL 4

Gene PPP4R4, Length 589 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R4-205	ENST00000556470	LY86	O95711	162 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	CRYAA	P02489	173 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	ZNF250	P15622	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	CFHR2	P36980	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	TMEM33	P57088	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	SELENOV	P59797	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	CATR1	Q13166	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	PDCD1	Q15116	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	IGFBP7	Q16270	282 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470		Q6ZPA2	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	WDR86	Q86TI4	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	STARD4	Q96DR4	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	RAB40C	Q96S21	281 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	BTBD17	A6NE02	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470		A6NLC8	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	LGALS8	O00214	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	SIRPB1	O00241	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	HSD17B6	O14756	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	MLNR	O43193	412 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	KLK10	O43240	276 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	SPINT2	O43291	252 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	ADAM20	O43506	726 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	DFFB	O76075	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	HEXA	P06865	529 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	GRP	P07492	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	ADH4	P08319	380 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	SPP1	P10451	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	VCAN	P13611	3396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	IL2RG	P31785	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	MPV17	P39210	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	CAV2	P51636	162 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	TAS2R30	P59541	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	MIDN	Q504T8	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	WDR82	Q6UXN9	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	STX12	Q86Y82	276 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	ZNF488	Q96MN9	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	WASF3	Q9UPY6	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP4R4-205	ENST00000556470	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms