RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 BMPR1BO00238 502 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 C7orf66A4D0T2 115 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 C11orf94C9JXX5 98 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 CLDN14O95500 239 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 ZAR1Q86SH2 424 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZT83 130 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 OR10C1Q96KK4 312 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 OR2V2Q96R30 315 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM222Q9H0R3 208 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 ARID2Q68CP9 1835 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 H3BP45 60 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 TSPOP30536 169 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 LRRC37A2A6NM11 1700 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 MEOX2P50222 304 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 MVDP53602 400 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF146Q15072 292 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 SLC2A8Q9NY64 477 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 PRSS50Q9UI38 385 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 F5H697 171 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 MFAP4P55083 255 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00862A6NCI5 91 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 C17orf51A8MQB3 221 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 H0Y8G0 127 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 OR2H2O95918 312 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 PATE4P0C8F1 98 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 CLDN18P56856 261 aa7.35□□□□□ -1.23
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