RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544675.1

NDUFA9-208, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9, human

TSL 4

Gene NDUFA9, Length 857 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDUFA9-208	ENST00000544675	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	NPBWR2	P48146	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	ATP5J2	P56134	94 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	TPPP2	P59282	170 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	PLP1	P60201	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	LPAL2	Q16609	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	MEP1B	Q16820	701 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	LTC4S	Q16873	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675		Q6ZN92	141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	TMEM45B	Q96B21	275 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	GALM	Q96C23	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	GPR82	Q96P67	336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	CMC2	Q9NRP2	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675		A0A087WV62	115 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675		A0A0G2JMM0	328 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675		A0A1W2PPB8	328 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675		K7EQM0	130 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675		K7N7A8	449 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	HAND1	O96004	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	TACSTD2	P09758	323 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	PSG2	P11465	335 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	FUT3	P21217	361 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	OTX2	P32243	289 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	PYCR1	P32322	319 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	GYG1	P46976	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	LCN2	P80188	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	PSG9	Q00887	426 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	UPP1	Q16831	310 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675		Q6ZSR6	202 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	GPSM1	Q86YR5	675 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	OR10C1	Q96KK4	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	MYADM	Q96S97	322 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	GFI1	Q99684	422 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NDUFA9-208	ENST00000544675	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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