RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 MED9Q9NWA0 146 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 H7C1Q1 480 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 MED6O75586 246 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 PLAUP00749 431 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 IFNA6P05013 189 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 FCGR3AP08637 254 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SFTA3P0C7M3 94 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 RPA2P15927 270 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 GATA4P43694 442 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 TAS2R46P59540 309 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 Q6P435 159 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 RDH5Q92781 318 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 DIRC2Q96SL1 478 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 CXorf65A6NEN9 183 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 C17orf100A8MU93 164 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SH2D1BO14796 132 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 BCL2L11O43521 198 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 OR2H2O95918 312 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 OR5H2Q8NGV7 314 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 PRRT1Q99946 306 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 A0A0D9SG52 128 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SRRM5B3KS81 715 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SIRPB1O00241 398 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 CLN5O75503 358 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 HAND1O96004 215 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 IL5P05113 134 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ADH4P08319 380 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 CFHR2P36980 270 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 DHODHQ02127 395 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ZNF843Q8N446 348 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SLC2A8Q9NY64 477 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 RNF222A6NCQ9 220 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 B9A039 149 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ZNF616Q08AN1 781 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 PPP1R1AQ13522 171 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 EFNB3Q15768 340 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SSX9Q7RTT3 188 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ERGIC1Q969X5 290 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 GCM1Q9NP62 436 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 MMP24Q9Y5R2 645 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 KNG1P01042 644 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 IFNA4P05014 189 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 CD55P08174 381 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 EGR1P18146 543 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 TNFRSF1AP19438 455 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 NDUFA6P56556 154 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 CCL8P80075 99 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ARRDC1Q8N5I2 433 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 CCDC107Q8WV48 283 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 A0A1W2PPE2 198 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ADAP1O75689 374 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 NAPSAO96009 420 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 S100PP25815 95 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 TESK1Q15569 626 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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