RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539490.1

DYRK4-208, Transcript of dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 4, human

TSL 2

Gene DYRK4, Length 447 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DYRK4-208	ENST00000539490	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ASCL2	Q99929	193 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	GON7	Q9BXV9	100 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	AMBN	Q9NP70	447 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ING4	Q9UNL4	249 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	TNC	P24821	2201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	TMEM212	A6NML5	194 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	MOS	P00540	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ALPL	P05186	524 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ELANE	P08246	267 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	GABRB1	P18505	474 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	CD1B	P29016	333 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	SOX2	P48431	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	RASSF2	P50749	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	F2RL1	P55085	397 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	FOXE3	Q13461	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490		Q8N6K4	173 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	OR52N1	Q8NH53	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	S1PR3	Q99500	378 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	EI24	O14681	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	SLC31A2	O15432	143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ORC5	O43913	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ATP5H	O75947	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	IGHG4	P01861	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	MT-ND4	P03905	459 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	CD2	P06729	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	SERPINA2	P20848	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	VDAC1	P21796	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	IL3RA	P26951	378 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	SOX6	P35712	828 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	VHL	P40337	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ALDH3A2	P51648	485 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF134	P52741	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	CFHR3	Q02985	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	NEK7	Q8TDX7	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	KCTD7	Q96MP8	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	S100A13	Q99584	98 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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