RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533170.1

AP003555.2-202, humanhuman

TSL 3

Gene AP003555.2, Length 369 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP003555.2-202ENST00000533170 LAMC1P11047 1609 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 IQGAP2Q13576 1575 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 ABCC3O15438 1527 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 ARAP3Q8WWN8 1544 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 MYADML2A6NDP7 307 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 B4DEV8 164 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 FNDC10F2Z333 226 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 G3V2L1 256 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 FAM20BO75063 409 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 CLDN14O95500 239 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 FGF1P05230 155 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 OR4A8P0C604 315 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 MYOD1P15172 320 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 GPD1P21695 349 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 CFPP27918 469 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 SLC35A1P78382 337 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 PDGFRLQ15198 375 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 OR2T5Q6IEZ7 315 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 ZNF549Q6P9A3 640 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 APOOLQ6UXV4 268 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 SSX8Q7RTT4 187 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 TMEM150AQ86TG1 271 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 OR2T29Q8NH02 315 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 IL17DQ8TAD2 202 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 CD99L2Q8TCZ2 262 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 IL1F10Q8WWZ1 152 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 Q96MF0 132 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 SELENOIQ9C0D9 397 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 TMEM133Q9H2Q1 129 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 SLC25A19Q9HC21 320 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 IL36AQ9UHA7 158 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 FZD1Q9UP38 647 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 TPRKBQ9Y3C4 175 aa4.84□□□□□ -1.63
AP003555.2-202ENST00000533170 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 PLIN4Q96Q06 1357 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 OR2M5A3KFT3 312 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 C15orf62A8K5M9 175 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 HMSDA8MTL9 139 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 TMEM262E9PQX1 116 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 K7EQS6 105 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 NPFFO15130 113 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 BCL2L11O43521 198 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 DEDDO75618 318 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 NDUFB8O95169 186 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 TNFP01375 233 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 CTSEP14091 401 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 SHC1P29353 583 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 REG1BP48304 166 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 INPP1P49441 399 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 MIDNQ504T8 468 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 FRG2Q64ET8 278 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 LCN10Q6JVE6 187 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 Q6Q795 121 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 LRRTM1Q86UE6 522 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 GAPTQ8N292 157 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 KCNRGQ8N5I3 272 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 LINC00301Q8NCQ3 95 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 NUP35Q8NFH5 326 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 OR1J4Q8NGS1 313 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 OR8S1Q8NH09 359 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 OLIG1Q8TAK6 271 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 NT5CQ8TCD5 201 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 C10orf82Q8WW14 230 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 TFAP2CQ92754 450 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 LINC00477Q96M19 166 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 FAM173AQ9BQD7 235 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 NUDT4Q9NZJ9 180 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 RNF11Q9Y3C5 154 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 FIS1Q9Y3D6 152 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa4.83□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 RGS12O14924 1447 aa4.82□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 SIPA1L1O43166 1804 aa4.82□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 SCN4AP35499 1836 aa4.82□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 A0A1B0GTL3 188 aa4.82□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 OR51F1A6NGY5 319 aa4.82□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 IFITM10A6NMD0 228 aa4.82□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 ZAR1LA6NP61 321 aa4.82□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 CD300LBA8K4G0 201 aa4.82□□□□□ -1.64
AP003555.2-202ENST00000533170 FAM220BPB1ANY3 271 aa4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.7 ms