RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530199.5

SVIP-204, Transcript of small VCP interacting protein, human

TSL 2

Gene SVIP, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SVIP-204	ENST00000530199	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	STMN2	Q93045	179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	VGLL1	Q99990	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	ALG12	Q9BV10	488 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199		A0A1W2PRG6	482 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	CD300LB	A8K4G0	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	IGHG4	P01861	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	C1QC	P02747	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	CCL3L1	P16619	93 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	PSMB8	P28062	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	ARHGDIB	P52566	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	CRISP3	P54108	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	DLX6	P56179	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	CD47	Q08722	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	TATDN3	Q17R31	274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	PGAP1	Q75T13	922 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	WDR86	Q86TI4	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	OR4C12	Q96R67	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199		K7EQM0	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	FGF16	O43320	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	REN	P00797	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	LINC00032	P0C843	101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	CLDN8	P56748	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	MS4A2	Q01362	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	AQP6	Q13520	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	LCN8	Q6JVE9	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	ARPC1A	Q92747	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	RBP7	Q96R05	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	ZNF222	Q9UK12	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVIP-204	ENST00000530199	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199		H0Y980	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	AZIN1	O14977	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	TSPAN19	P0C672	248 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	HTR1D	P28221	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	ESRRG	P62508	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	DR1	Q01658	176 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	CASP8	Q14790	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	FCN2	Q15485	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	OR1Q1	Q15612	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	LYG2	Q86SG7	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SVIP-204	ENST00000530199	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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