RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 HIF1ANQ9NWT6 349 aa13.76□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 J3QLI3 93 aa13.75□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 FABP7O15540 132 aa13.75□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 SPINT2O43291 252 aa13.75□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 RBBP9O75884 186 aa13.75□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 PPP5CP53041 499 aa13.75□□□□□ -0.21
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PACS1-208ENST00000529677 ZNF846Q147U1 533 aa13.75□□□□□ -0.21
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PACS1-208ENST00000529677 TNFRSF14Q92956 283 aa13.74□□□□□ -0.21
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PACS1-208ENST00000529677 CCDC32Q9BV29 185 aa13.74□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 TOLLIPQ9H0E2 274 aa13.74□□□□□ -0.21
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PACS1-208ENST00000529677 AWAT1Q58HT5 328 aa13.72□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 OR52W1Q6IF63 320 aa13.72□□□□□ -0.21
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PACS1-208ENST00000529677 DEDD2Q8WXF8 326 aa13.72□□□□□ -0.21
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PACS1-208ENST00000529677 A0A0A6YYJ9 748 aa13.71□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 TOX4O94842 621 aa13.71□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 IL7P13232 177 aa13.71□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 OMGP23515 440 aa13.71□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 SRP14P37108 136 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 TAS2R19P59542 299 aa13.71□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 IGSF11Q5DX21 431 aa13.71□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 VAX1Q5SQQ9 334 aa13.71□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 HCP5Q6MZN7 132 aa13.71□□□□□ -0.21
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PACS1-208ENST00000529677 VMO1Q7Z5L0 202 aa13.71□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 C8orf31Q8N9H6 132 aa13.71□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 FAM216AQ8WUB2 273 aa13.71□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 TMEM133Q9H2Q1 129 aa13.71□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 OCEL1Q9H607 264 aa13.71□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 AUP1Q9Y679 476 aa13.71□□□□□ -0.21
PACS1-208ENST00000529677 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
PACS1-208ENST00000529677 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
PACS1-208ENST00000529677 ITGB1BP1O14713 200 aa13.7□□□□□ -0.22
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