RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528787.1

SSBP3-211, Transcript of single stranded DNA binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene SSBP3, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3-211ENST00000528787 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 AKAIN1P0CW23 69 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 CGB3P0DN86 165 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 CGB7P0DN87 165 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 BRS3P32247 399 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 PPP5CP53041 499 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 DEFA1P59665 94 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 DEFA3P59666 94 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 HERV-K104P61576 105 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 MADCAM1Q13477 382 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 ZNF273Q14593 569 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 AANATQ16613 207 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 LINC00311Q8N616 119 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 MALSU1Q96EH3 234 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 TSC22D3Q99576 134 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 DUX4Q9UBX2 424 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 ZNF69Q9UC07 566 aa6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 A0A0A6YYJ9 748 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 FAM172BPA6NC97 362 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 RNF212BA8MTL3 300 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 C15orf65H3BRN8 121 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 J3QR06 171 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 ST8SIA5O15466 376 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 IFNA2P01563 188 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 IGHV1-69P01742 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 TFF1P04155 84 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 ARG1P05089 322 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 FCER2P06734 321 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 OR5H8P0DN80 308 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 MMP9P14780 707 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 CCL3L1P16619 93 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 SRD5A1P18405 259 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 SSTR5P35346 364 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 GDNFP39905 211 aa6.5□□□□□ -1.37
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SSBP3-211ENST00000528787 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 DLX6P56179 175 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 PLA2G7Q13093 441 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 DYRK1AQ13627 763 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 MORN2Q502X0 79 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 DYRK2Q92630 601 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 LHX4Q969G2 390 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 RPEQ96AT9 228 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 ABHD1Q96SE0 405 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 SOSTQ9BQB4 213 aa6.5□□□□□ -1.37
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SSBP3-211ENST00000528787 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 MMP28Q9H239 520 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 MMP26Q9NRE1 261 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 EHFQ9NZC4 300 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 COPZ2Q9P299 210 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 DPM3Q9P2X0 92 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 GAB2Q9UQC2 676 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 MED13LQ71F56 2210 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.5□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 HIVEP2P31629 2446 aa6.49□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.49□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 NPFFO15130 113 aa6.49□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 BET1O15155 118 aa6.49□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 B3GALNT1O75752 331 aa6.49□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 RAB3DO95716 219 aa6.49□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SSBP3-211ENST00000528787 GSTT2P0CG29 244 aa6.49□□□□□ -1.37
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