RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 THTPAQ9BU02 230 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CLEC7AQ9BXN2 247 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 GABARAPL3Q9BY60 117 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 BARHL1Q9BZE3 327 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CHIAQ9BZP6 476 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 VCXQ9H320 206 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF446Q9NWS9 450 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 FAM206AQ9NX38 181 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 TAS2R1Q9NYW7 299 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CTSZQ9UBR2 303 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CKLFQ9UBR5 152 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 OR52A1Q9UKL2 312 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 HHLA2Q9UM44 414 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 TCF19Q9Y242 345 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 PIGLQ9Y2B2 252 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 U3KQV3 271 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 V9GYQ6 96 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 VWFP04275 2813 aa3.37□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 PQLC2LA1A4F0 135 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 BUB3O43684 328 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ANGPTL7O43827 346 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 GLAP06280 429 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 PSG2P11465 335 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 GZMHP20718 246 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 MDKP21741 143 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 PMELP40967 661 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 PTGFRP43088 359 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 GLIPR1P48060 266 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 EFNB2P52799 333 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CXCR4P61073 352 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 PPP3R1P63098 170 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CSNK2BP67870 215 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 BDH1Q02338 343 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 RAB40BQ12829 278 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 MPV17LQ2QL34 196 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM255AQ5JRV8 349 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 C1orf146Q5VVC0 180 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 C12orf73Q69YU5 71 aa3.36□□□□□ -1.87
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HDAC2-216ENST00000523628 ASPHD2Q6ICH7 369 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 HEPN1Q6WQI6 88 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 BRD3OSQ6XYD6 125 aa3.36□□□□□ -1.87
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HDAC2-216ENST00000523628 NFE4Q86UQ8 179 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 SERPINA12Q8IW75 414 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 STX19Q8N4C7 294 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ACBD7Q8N6N7 88 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 YIPF7Q8N8F6 280 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
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HDAC2-216ENST00000523628 OR51A2Q8NGJ7 313 aa3.36□□□□□ -1.87
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HDAC2-216ENST00000523628 OR8D4Q8NGM9 314 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 OR4Q3Q8NH05 313 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 OR51E1Q8TCB6 317 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CANT1Q8WVQ1 401 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 SLAMF9Q96A28 289 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CCL13Q99616 98 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 SSX3Q99909 188 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 C9orf16Q9BUW7 83 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 GPR84Q9NQS5 396 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 TVP23BQ9NYZ1 205 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 IL36GQ9NZH8 169 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 DPM3Q9P2X0 92 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 GHRLQ9UBU3 117 aa3.36□□□□□ -1.87
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HDAC2-216ENST00000523628 ZNF222Q9UK12 451 aa3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 MGAT4AQ9UM21 535 aa3.36□□□□□ -1.87
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HDAC2-216ENST00000523628 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 AP4S1Q9Y587 144 aa3.36□□□□□ -1.87
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HDAC2-216ENST00000523628 A0A0U1RQK1 487 aa3.35□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 FAM183AA6NL82 134 aa3.35□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 RFPL4AA6NLU0 287 aa3.35□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 C15orf62A8K5M9 175 aa3.35□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ODF3BA8MYP8 253 aa3.35□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa3.35□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 H3BUX3 64 aa3.35□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 BMPR1BO00238 502 aa3.35□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 TOR1AO14656 332 aa3.35□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 AKR7A2O43488 359 aa3.35□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 RAMP3O60896 148 aa3.35□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 OR2F2O95006 317 aa3.35□□□□□ -1.87
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