RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	CST11	Q9H112	138 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	VCX3B	Q9H321	246 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	SHISA3	A0PJX4	238 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014		G3V4G9	280 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCRL2	O00421	344 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC17A2	O00624	439 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	BPNT1	O95861	308 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	HNF4G	Q14541	408 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB26	Q9ULW5	256 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014		H3BUI4	141 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014		M0QZK8	103 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	LDLRAD4	O15165	306 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	SOCS1	O15524	211 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPINT2	O43291	252 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	FGF16	O43320	207 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	NAPSA	O96009	420 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM11	P17152	192 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM50B	P56557	158 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLA2G7	Q13093	441 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	P2RY14	Q15391	338 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAM1	Q15629	374 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	HMGN3	Q15651	99 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	MORN2	Q502X0	79 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	MOB3B	Q86TA1	216 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRR18	Q8N4B5	295 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	SVOP	Q8N4V2	548 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	GNG12	Q9UBI6	72 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC01548	A6NM66	108 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLDN12	P56749	244 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	HTD2	P86397	168 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	HES1	Q14469	280 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	STEAP3	Q658P3	488 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q8N9W7	124 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	PEX14	O75381	377 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARL6IP5	O75915	188 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHG2	P01859	326 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARSB	P15848	533 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD1B	P29016	333 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	R3HDM4	Q96D70	268 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	JPT1	Q9UK76	154 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1W2PRX2	142 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	LANCL1	O43813	399 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	YPEL1	O60688	119 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL3RA	P26951	378 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	F2RL1	P55085	397 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR10A3	P58181	314 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	GABARAPL2	P60520	117 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB11B	Q15907	218 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF329	Q86UD4	541 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		10.03	□□□□□ -0.8

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