RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		0.95	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		0.95	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		0.95	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	SCML1	Q9UN30	329 aa		0.95	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	COL18A1	P39060	1754 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	GPR171	O14626	319 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	TNFAIP8	O95379	198 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	SOD1	P00441	154 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	TPM1	P09493	284 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	GZMB	P10144	247 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	CTSE	P14091	401 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	NQO2	P16083	231 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	CD200	P41217	278 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	SLC35A2	P78381	396 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	PDGFRL	Q15198	375 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	PSG3	Q16557	428 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268		Q3ZCU0	254 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	OR10A6	Q8NH74	314 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	MGLL	Q99685	303 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	COMMD9	Q9P000	198 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	ALG5	Q9Y673	324 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	ADGRB3	O60242	1522 aa		0.94	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	PLXNA3	P51805	1871 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	GBF1	Q92538	1859 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268		A0A1B0GX12	115 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268		C9J4A7	227 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	SGCE	O43556	437 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	IVL	P07476	585 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	SLC25A16	P16260	332 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	CD36	P16671	472 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	ORM2	P19652	201 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	GADD45A	P24522	165 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	PSMD7	P51665	324 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	ACTB	P60709	375 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	C1QTNF8	P60827	252 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	ACTG1	P63261	375 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	SS18	Q15532	418 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	MBOAT7	Q96N66	472 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	SERPINB11	Q96P15	392 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	MED18	Q9BUE0	208 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		0.93	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	PTPRJ	Q12913	1337 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268		H3BSA7	217 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	LY6H	O94772	140 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	PRB1	P04280	392 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	LIMS3	P0CW19	117 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	LIMS4	P0CW20	117 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	SYT1	P21579	422 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	GTF2B	Q00403	316 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	RASL11A	Q6T310	242 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	OR11H1	Q8NG94	326 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	DCANP1	Q8TF63	244 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	CYTH2	Q99418	400 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	GPR22	Q99680	433 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	CHST5	Q9GZS9	411 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	SLIT2	O94813	1529 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		0.92	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268		A0A0G2JQZ4	141 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	LINC00862	A6NCI5	91 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		0.91	□□□□□ -2.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms