RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 GPR179Q6PRD1 2367 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 C1orf226A1L170 272 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 NPIPB5A8MRT5 1133 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM150CB9EJG8 249 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 H7C1C5 153 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 HSPB6O14558 160 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 LYRM1O43325 122 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 SIX6O95475 246 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ADIGQ0VDE8 80 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 PPP1R1AQ13522 171 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGGTB-214ENST00000497648 CLEC12BQ2HXU8 276 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGGTB-214ENST00000497648 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 C1orf195Q5TG92 126 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 MFSD12Q6NUT3 480 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGGTB-214ENST00000497648 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF440Q8IYI8 595 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 SPEM1Q8N4L4 309 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 TTC9CQ8N5M4 171 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
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RABGGTB-214ENST00000497648 ACVR1CQ8NER5 493 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 OLIG1Q8TAK6 271 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 CLEC4CQ8WTT0 213 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 NPIPB3Q92617 1050 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGGTB-214ENST00000497648 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGGTB-214ENST00000497648 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGGTB-214ENST00000497648 ACER3Q9NUN7 267 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 C1RLQ9NZP8 487 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 FLRT3Q9NZU0 649 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGGTB-214ENST00000497648 VDAC3Q9Y277 283 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
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RABGGTB-214ENST00000497648 DIRAS1O95057 198 aa7.45□□□□□ -1.22
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RABGGTB-214ENST00000497648 SDHBP21912 280 aa7.45□□□□□ -1.22
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RABGGTB-214ENST00000497648 SHC1P29353 583 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 MPGP29372 298 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 HIST1H2BBP33778 126 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 MEOX1P50221 254 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 NUDT2P50583 147 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 HIST1H2BDP58876 126 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 HIST1H2BCP62807 126 aa7.45□□□□□ -1.22
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RABGGTB-214ENST00000497648 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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RABGGTB-214ENST00000497648 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.45□□□□□ -1.22
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RABGGTB-214ENST00000497648 DTX2Q86UW9 622 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 OR5D16Q8NGK9 328 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF488Q96MN9 340 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 VAMP8Q9BV40 100 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 DPY30Q9C005 99 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 RHOJQ9H4E5 214 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 C1orf123Q9NWV4 160 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.45□□□□□ -1.22
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