RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495588.2

GAPVD1-218, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, human

TSL 5

Gene GAPVD1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	DYRK2	Q92630	601 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PECR	Q9BY49	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	DIABLO	Q9NR28	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF222	Q9UK12	451 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588		A0A0A6YYH2	397 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ISPD	A4D126	451 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588		A6NJ64	397 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CLDN25	C9JDP6	229 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588		J3QRK9	145 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	DEGS1	O15121	323 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SSX4	O60224	188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PDCD6	O75340	191 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF737	O75373	536 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	FCN3	O75636	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SCGN	O76038	276 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SELL	P14151	372 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PAX1	P15863	534 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	FUT3	P21217	361 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PRDX2	P32119	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	MNDA	P41218	407 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ATP5J2	P56134	94 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF45	Q02386	682 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	MICB	Q29980	383 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PYDC2	Q56P42	97 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	S100Z	Q8WXG8	99 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	GAFA1	Q96PS6	74 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CCL13	Q99616	98 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PPA2	Q9H2U2	334 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	TMEM165	Q9HC07	324 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	GLS2	Q9UI32	602 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	AK3	Q9UIJ7	227 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GAPVD1-218	ENST00000495588	SERPINE3	A8MV23	424 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GAPVD1-218	ENST00000495588	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GAPVD1-218	ENST00000495588	ADAM20	O43506	726 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GAPVD1-218	ENST00000495588	LANCL1	O43813	399 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GAPVD1-218	ENST00000495588	SSX5	O60225	188 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GAPVD1-218	ENST00000495588	RGS11	O94810	467 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GAPVD1-218	ENST00000495588	TPPP	O94811	219 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GAPVD1-218	ENST00000495588	FSTL3	O95633	263 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GAPVD1-218	ENST00000495588	FCER2	P06734	321 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GAPVD1-218	ENST00000495588	MELTF	P08582	738 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GAPVD1-218	ENST00000495588	CD3G	P09693	182 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GAPVD1-218	ENST00000495588	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.52	□□□□□ -1.69
GAPVD1-218	ENST00000495588	GIF	P27352	417 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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