RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 VDAC1P21796 283 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 GLIPR1P48060 266 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 IGSF11Q5DX21 431 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 ELP2Q6IA86 826 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF649Q9BS31 505 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 DPRXA6NFQ7 191 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 CDKN1AP38936 164 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 PERPQ96FX8 193 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 ZGRF1Q86YA3 2104 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 CACNA1AO00555 2505 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 IAPPP10997 89 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 WDR82Q6UXN9 313 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 LURAP1Q96LR2 239 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 ARID1AO14497 2285 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRD-211ENST00000486161 THBDP07204 575 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 PSG2P11465 335 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 NQO2P16083 231 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 F2RP25116 425 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 TLE4Q04727 773 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 HNF4GQ14541 408 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRD-211ENST00000486161 OR1L1Q8NH94 360 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
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PTPRD-211ENST00000486161 POM121CA8CG34 1229 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRD-211ENST00000486161 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRD-211ENST00000486161 MED13Q9UHV7 2174 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 JTBO76095 146 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRD-211ENST00000486161 FAM201AQ5SY85 155 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF66Q6ZN08 573 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 Q6ZRG5 221 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 HPSE2Q8WWQ2 592 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 I3L521 148 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 ARG1P05089 322 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF250P15622 560 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 ARF6P62330 175 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 COLCA1Q6ZS62 124 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 OR9G1Q8NH87 305 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRD-211ENST00000486161 E9PQ18 207 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRD-211ENST00000486161 CT45A5P0DMU8 189 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 CT45A7P0DMV0 189 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRD-211ENST00000486161 CT45A1Q5HYN5 189 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRD-211ENST00000486161 MOB3AQ96BX8 217 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 LRP4O75096 1905 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRD-211ENST00000486161 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 ACACBO00763 2458 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 IGF2RP11717 2491 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PPE3 182 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 PLAC9Q5JTB6 97 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 OR4D10Q8NGI6 311 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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