RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484412.1

HDLBP-240, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 669 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-240ENST00000484412 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 DCSTAMPQ9H295 470 aa11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 KCNK15Q9H427 330 aa11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 AK3Q9UIJ7 227 aa11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 GAB2Q9UQC2 676 aa11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 TCF19Q9Y242 345 aa11.25□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 TRAV39A0A0B4J263 110 aa11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 A6NDX4 124 aa11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 RGS11O94810 467 aa11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 GABARAPO95166 117 aa11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 CRYBA1P05813 215 aa11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 CLEC2LP0C7M8 214 aa11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 NFYBP25208 207 aa11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 ARHGDIBP52566 201 aa11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 CTF1Q16619 201 aa11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 MOGAT2Q3SYC2 334 aa11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF260Q3ZCT1 412 aa11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 UTF1Q5T230 341 aa11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 Q6ZPA2 131 aa11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 OR8H3Q8N146 312 aa11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 C12orf4Q9NQ89 552 aa11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 C1RLQ9NZP8 487 aa11.24□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 H3BUX3 64 aa11.23□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 DTYMKP23919 212 aa11.23□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 MNDAP41218 407 aa11.23□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 RPL5P46777 297 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 MXD1Q05195 221 aa11.23□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 MADCAM1Q13477 382 aa11.23□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 CDNFQ49AH0 187 aa11.23□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 CT45A1Q5HYN5 189 aa11.23□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 OR4F5Q8NH21 305 aa11.23□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 OR1L1Q8NH94 360 aa11.23□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 CT45A3Q8NHU0 189 aa11.23□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.23□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 ATG5Q9H1Y0 275 aa11.23□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 OR2S2Q9NQN1 319 aa11.23□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 TRDCB7Z8K6 153 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 TXNL1O43396 289 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 TPPPO94811 219 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 SERPINB10P48595 397 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 TMBIM6P55061 237 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 RELBQ01201 579 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 KIR2DS1Q14954 304 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 IDNKQ5T6J7 187 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 HACD4Q5VWC8 232 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 FAM71F2Q6NXP2 309 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 C11orf88Q6PI97 169 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 Q8N2B8 174 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 OR4A4PQ8NGN8 299 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 NDNFQ8TB73 568 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 CFHR4Q92496 578 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 CYYR1Q96J86 154 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 DUX5Q96PT3 197 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 AGMATQ9BSE5 352 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF747Q9BV97 191 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 DIABLOQ9NR28 239 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 ABCB10Q9NRK6 738 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 RHBDL2Q9NX52 303 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 HILPDAQ9Y5L2 63 aa11.22□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 A0A0B4J203 849 aa11.21□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 CLPSL1A2RUU4 121 aa11.21□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 LANCL1O43813 399 aa11.21□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 CD3GP09693 182 aa11.21□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 ZBTB25P24278 435 aa11.21□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 CD1BP29016 333 aa11.21□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 RORCP51449 518 aa11.21□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 AWAT1Q58HT5 328 aa11.21□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 Q6ZSV7 163 aa11.21□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 GPR141Q7Z602 305 aa11.21□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 OR5H6Q8NGV6 325 aa11.21□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 LINC01006Q8NI28 216 aa11.21□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 BEX1Q9HBH7 125 aa11.21□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 GNG12Q9UBI6 72 aa11.21□□□□□ -0.61
HDLBP-240ENST00000484412 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa11.2□□□□□ -0.62
HDLBP-240ENST00000484412 XRCC3O43542 346 aa11.2□□□□□ -0.62
HDLBP-240ENST00000484412 LPLP06858 475 aa11.2□□□□□ -0.62
HDLBP-240ENST00000484412 SCTP09683 121 aa11.2□□□□□ -0.62
HDLBP-240ENST00000484412 CTXN2P0C2S0 81 aa11.2□□□□□ -0.62
HDLBP-240ENST00000484412 FAM106CPP0CH98 169 aa11.2□□□□□ -0.62
HDLBP-240ENST00000484412 GNB3P16520 340 aa11.2□□□□□ -0.62
HDLBP-240ENST00000484412 IL3RAP26951 378 aa11.2□□□□□ -0.62
HDLBP-240ENST00000484412 RAB13P51153 203 aa11.2□□□□□ -0.62
HDLBP-240ENST00000484412 NCS1P62166 190 aa11.2□□□□□ -0.62
HDLBP-240ENST00000484412 HLA-DRB3P79483 266 aa11.2□□□□□ -0.62
HDLBP-240ENST00000484412 GPR107Q5VW38 600 aa11.2□□□□□ -0.62
HDLBP-240ENST00000484412 OLFML2AQ68BL7 652 aa11.2□□□□□ -0.62
HDLBP-240ENST00000484412 C12orf54Q6X4T0 127 aa11.2□□□□□ -0.62
HDLBP-240ENST00000484412 ODF3L1Q8IXM7 274 aa11.2□□□□□ -0.62
HDLBP-240ENST00000484412 OR10X1Q8NGY0 326 aa11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms